[发明专利]一种链霉菌微型转座突变系统及其构建方法和应用有效

专利信息
申请号: 201010610631.7 申请日: 2010-12-29
公开(公告)号: CN102154268A 公开(公告)日: 2011-08-17
发明(设计)人: 丁晓明;张欣城;鲍芸;张渤;张霖;赵国屏 申请(专利权)人: 复旦大学
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12N15/63;C12N15/113
代理公司: 上海正旦专利代理有限公司 31200 代理人: 陆飞;盛志范
地址: 200433 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 霉菌 微型 突变 系统 及其 构建 方法 应用
【权利要求书】:

1.一对IS204的转座酶识别序列,其特征在于为IRL和IRR位点,其序列分别为SEQ ID No. 1和SEQ ID No. 2所示。

2.一个用于转座的质粒,其特征在于由基于权利要求1所述的转座酶识别位点序列所构建,序列如SEQ ID No. 20所示,记为pDZY101。

3.如权利要求2所述转座质粒的相应元件,其特征在于包括质粒复制起始位点、抗药性基因、转座酶基因、接合转移起始位点、红霉素启动子以及转座酶识别位点IRL、IRR-1和IRR。

4.如权利要求2所述转座质粒的构建方法,其特征在于具体步骤如下:

以红色糖多孢菌Saccharopolyspora erythraea为模板,用引物SEQ ID No. 3和引物SEQ ID No. 4扩增红霉素启动子片段,引物两端分别设计有XbaI和BamHI的限制性内切酶识别位点,把PCR产物片段与pMD19-T载体做T-A克隆后转化大肠杆菌,挑取阳性转化子并提取质粒DNA,即为pT-ermE ;以诺卡氏菌Nocardia asteroids(mexicana) YP21基因组为模板,以引物SEQ ID No. 5和引物SEQ ID No. 6扩增转座酶基因片段,引物两端分别设计有BamHI和EcoRI的限制性内切酶识别位点, 用BamHI和EcoRI酶切该PCR产物片段和质粒pT-ermE,然后连接所得的两条线性片段,转化大肠杆菌,挑取阳性转化子并提取质粒DNA,即为pT-ermE-tnp;用XbaI和EcoRI分别酶切质粒pBY102和pT-ermE-tnp,再把所得线性片段用TDNA连接酶连接,转化大肠杆菌,挑取阳性转化子并提取质粒DNA,即为pDZY101。

5.如权利要求2所述转座质粒的衍生质粒,记为pDZY102~ pDZY107,其特征在于: 

在衍生质粒pDZY102结构图中:

 图谱标注          对应基因或功能      位置IRR       IS204转座酶的识别位点249-227aphII       卡那霉素抗性基因1375-451oriT       接合转移起始点1832-1943ermE       红霉素启动子2272-2398trans       IS204转座酶基因2398-3752IRR       IS204转座酶的识别位点3757-3787aac(3)IV       阿泊拉霉素抗性基因 4815-226

在衍生质粒pDZY103结构图中:

图谱标注          对应基因或功能      位置IRR       IS204转座酶的识别位点1347-1373aac(3)IV       阿泊拉霉素抗性基因 2378-3198IRL       IS204转座酶的识别位点3494-3464aphII       卡那霉素抗性基因4619-3695oriT       接合转移起始点5076-5187ermE       红霉素启动子5516-5642trans       IS204转座酶基因5642-1346

在衍生质粒pDZY104结构图中:

图谱标注          对应基因或功能      位置IRR       IS204转座酶的识别位点1347-1373aac(3)IV       阿泊拉霉素抗性基因 2378-3205trans’       IS204转座酶基因末端约300bp 3205-3513aphII       卡那霉素抗性基因4639-3715oriT       接合转移起始点5096-5207

ermE       红霉素启动子5536-5662trans       IS204转座酶基因5662-1346

在衍生质粒pDZY105结构图中:

           对应基因或功能      位置IRL       IS204转座酶的识别位点1347-1373aac(3)IV       阿泊拉霉素抗性基因 2378-3205trans’      IS204转座酶基因末端约300bp 3205-3513IRL       IS204转座酶的识别位点3514-3543aphII       卡那霉素抗性基因4669-3745oriT       接合转移起始点5126-5237ermE       红霉素启动子5566-5692trans       IS204转座酶基因5692-1346

在衍生质粒pDZY106结构图中:

           对应基因或功能      位置aac(3)IV       阿泊拉霉素抗性基因 595-5487IRR       IS204转座酶的识别位点1630-1600trans       IS204转座酶基因2989-1635ermE       红霉素启动子3115-2989oriT       接合转移起始点3555-3444aphII       卡那霉素抗性基因4012-4936IRL       IS204转座酶的识别位点5178-5149trans’       IS204转座酶基因末端约300bp 5486-5182

在衍生质粒pDZY107结构图中:

           对应基因或功能      位置aac(3)IV       阿泊拉霉素抗性基因 595-5248IRR       IS204转座酶的识别位点1630-1600trans       IS204转座酶基因2989-1635ermE       红霉素启动子3115-2989oriT       接合转移起始点3555-3444aphII      卡那霉素抗性基因4012-4936IRR       IS204转座酶的识别位点5227-5207trans’       IS204转座酶基因末端约16bp 5247-5232

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