[发明专利]禽流感病毒通用型套式荧光RT-PCR检测方法及检测试剂盒有效
申请号: | 201010576700.7 | 申请日: | 2010-12-07 |
公开(公告)号: | CN102071264A | 公开(公告)日: | 2011-05-25 |
发明(设计)人: | 杨素;沙才华;廖明;徐海聂;廖秀云 | 申请(专利权)人: | 中华人民共和国珠海出入境检验检疫局 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 广州市红荔专利代理有限公司 44214 | 代理人: | 王贤义 |
地址: | 519015 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 禽流感 病毒 通用型 荧光 rt pcr 检测 方法 试剂盒 | ||
1.一种禽流感病毒通用型套式荧光RT-PCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
A:取待测样品提取模板RNA;
B:设立阳性对照和阴性对照,按照配置好的反应体系,用外引物(P1、P2)进行一步法RT-PCR,所述外引物(P1、P2)的序列分别为:
P1:5’-TATTAGCAAAAGCAGGGTA-3’
P2:5’-GTAGTAGAAACAAGGGTATT-3’;
C:以上述一步法RT-PCR产物为模板,将内引物(P3、P4)及探针和反应组分置于荧光PCR仪中进行荧光PCR扩增反应,所述内引物(P3、P4)及探针序列分别为:
P3:5’-CGGACGAAAAGGCAACGA-3’
P4:5’-CATTGTCTCCGAAGAAATAAGATCCT-3’
探针:Fam-5’-CGATCGTGCCTTCCTTTGACA-3’-Eclipse;
D:反应结束后,根据信噪情况设定和调整基线和阈值,通过收集的荧光曲线和CT值判定结果。
2.根据权利要求1所述的禽流感病毒通用型套式荧光RT-PCR检测方法,其特征在于,所述步骤B中一步法RT-PCR的反应参数为:50℃ 30min,94℃ 3min,1个循环;94℃ 60s,53℃ 60s,72℃ 120s,30个循环;72℃延伸8min。
3.根据权利要求1所述的禽流感病毒通用型套式荧光RT-PCR检测方法,其特征在于,所述步骤C中荧光PCR的反应参数为:94℃ 10s,45℃ 30 s,72℃ 60s,3个循环;94℃ 10s,58℃ 35s,45个循环后收集荧光。
4.根据权利要求1所述的禽流感病毒通用型套式荧光RT-PCR检测方法,其特征在于,所述步骤B中阳性对照设立方法为:选取禽流感病毒RNA为模板,经过克隆筛选正确的重组克隆质粒,然后抽取所述重组克隆质粒对目的片段进行体外反转录,按一定浓度稀释后作为阳性对照。
5.根据权利要求1所述的禽流感病毒通用型套式荧光RT-PCR检测方法,其特征在于,所述步骤B中采用无菌抽取未接种任何病原体的正常SPF鸡胚的尿囊液作为阴性对照。
6.一种用于权利要求1所述的禽流感病毒通用型套式荧光RT-PCR检测方法的检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒中的PCR反应体系包括一步法RT-PCR反应体系和荧光PCR反应体系;
所述一步法RT-PCR反应体系的组分包括:10μmol/L的外引物P1 0.5μL,10μmol/L的外引物P2 0.5μL,PrimeScript 1 Step Enzyme Mix 1.0μL,2×1 Step Buffer 10.0μL,模板RNA溶液 2.0μL,DEPC H2O 6.0μL;
所述荧光PCR反应体系包括如下组分:
1×RT-PCR缓冲液 含10 mmol/L Tris-Cl,50 mmol/L KCl,pH8.3
dNTPs 0.2 mmol/L each
MgCl2 2.5 mmol/L
DTT 2 mmol/L
甘油 5%
Ex TagDNA酶 1 U/μL
内引物P3 0.9 μmol/L
内引物P4 0.9 μmol/L
探针 0.25 μmol/L。
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