[发明专利]纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法无效

专利信息
申请号: 201010503063.0 申请日: 2010-10-12
公开(公告)号: CN101956015A 公开(公告)日: 2011-01-26
发明(设计)人: 贺林;李璨;冯晓录;陈培华 申请(专利权)人: 上海交通大学;上海佰真生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 上海交达专利事务所 31201 代理人: 王锡麟;王桂忠
地址: 200240 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 纳米 颗粒 检测 核苷酸 多态性 方法
【权利要求书】:

1.一种纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征在于,包括如下步骤:

第一步,利用DNA折纸术构造一个非对称二维图形,制备DNA折纸芯片;

第二步,制备胶体金探针;

第三步,DNA短链与胶体金探针杂交;

第四步,粒径胶体金探针与非对称二维图形DNA折纸芯片连接;

第五步,单核苷酸多态性检测。

2.根据权利要求1所述的纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第一步中所述的DNA折纸芯片的制备方法:

(1)把所有要用的100μM订书钉链,包括形成非对称二维图形的、伸出探针的等体积混合,再稀释20倍备用;

(2)在96孔板上混合总量为30μl的溶液:0.025μM订书钉链:22μl;1/2浓度的M13mp18:1μl;1×TAE-Mg2+buffer:7μl。

3.根据权利要求1所述的纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第二步中所述的胶体金探针制备方法:

①寡核苷酸与5nm粒径胶体金摩尔浓度比200比1加入10mM磷酸缓冲液中,室温300rpm摇24小时;

②加入终浓度0.1M NaCl,室温300rpm摇48小时;

③4℃,15000rpm离心10分钟,弃上清;

④加入10mM磷酸缓冲液,终浓度0.1M NaCl清洗两次;

⑤加入1x TE;10mM Tris-HCl,1mM EDTA,pH=8.0,4℃保存;

⑥5nm粒径胶体金探针浓度利用520nm波长紫外吸收峰测定。

4.根据权利要求1所述的纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第三步中所述的杂交是指:5nm粒径胶体金探针与10nt DNA短链摩尔浓度比1比1混合,50℃水浴杂交1小时。

5.根据权利要求1所述的纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第四步中所述的连接是指:5nm粒径胶体金探针与非对称二维图形DNA折纸芯片摩尔浓度比2比1混合,37℃水浴杂交1小时。

6.根据权利要求1所述的纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第五步中所述的单核苷酸多态性检测的步骤:在原子力显微镜成像前,加入报告探针摩尔浓度2倍量的靶核苷酸链,取若干时间点原子力显微镜成像。

7.根据权利要求6所述的纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,所述的原子力显微镜成像,原本都是有亮点的,在某一时间后,完全互补的已没有亮点,根据分支迁移反应机制,加入两种toehold长短不同靶核苷酸链,单碱基突变的仍有明显亮点。

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