[发明专利]纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法无效
申请号: | 201010503063.0 | 申请日: | 2010-10-12 |
公开(公告)号: | CN101956015A | 公开(公告)日: | 2011-01-26 |
发明(设计)人: | 贺林;李璨;冯晓录;陈培华 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学;上海佰真生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海交达专利事务所 31201 | 代理人: | 王锡麟;王桂忠 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 纳米 颗粒 检测 核苷酸 多态性 方法 | ||
1.一种纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征在于,包括如下步骤:
第一步,利用DNA折纸术构造一个非对称二维图形,制备DNA折纸芯片;
第二步,制备胶体金探针;
第三步,DNA短链与胶体金探针杂交;
第四步,粒径胶体金探针与非对称二维图形DNA折纸芯片连接;
第五步,单核苷酸多态性检测。
2.根据权利要求1所述的纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第一步中所述的DNA折纸芯片的制备方法:
(1)把所有要用的100μM订书钉链,包括形成非对称二维图形的、伸出探针的等体积混合,再稀释20倍备用;
(2)在96孔板上混合总量为30μl的溶液:0.025μM订书钉链:22μl;1/2浓度的M13mp18:1μl;1×TAE-Mg2+buffer:7μl。
3.根据权利要求1所述的纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第二步中所述的胶体金探针制备方法:
①寡核苷酸与5nm粒径胶体金摩尔浓度比200比1加入10mM磷酸缓冲液中,室温300rpm摇24小时;
②加入终浓度0.1M NaCl,室温300rpm摇48小时;
③4℃,15000rpm离心10分钟,弃上清;
④加入10mM磷酸缓冲液,终浓度0.1M NaCl清洗两次;
⑤加入1x TE;10mM Tris-HCl,1mM EDTA,pH=8.0,4℃保存;
⑥5nm粒径胶体金探针浓度利用520nm波长紫外吸收峰测定。
4.根据权利要求1所述的纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第三步中所述的杂交是指:5nm粒径胶体金探针与10nt DNA短链摩尔浓度比1比1混合,50℃水浴杂交1小时。
5.根据权利要求1所述的纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第四步中所述的连接是指:5nm粒径胶体金探针与非对称二维图形DNA折纸芯片摩尔浓度比2比1混合,37℃水浴杂交1小时。
6.根据权利要求1所述的纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第五步中所述的单核苷酸多态性检测的步骤:在原子力显微镜成像前,加入报告探针摩尔浓度2倍量的靶核苷酸链,取若干时间点原子力显微镜成像。
7.根据权利要求6所述的纳米金颗粒检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,所述的原子力显微镜成像,原本都是有亮点的,在某一时间后,完全互补的已没有亮点,根据分支迁移反应机制,加入两种toehold长短不同靶核苷酸链,单碱基突变的仍有明显亮点。
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