[发明专利]一种BAC DNA指纹分析的标记方法无效

专利信息
申请号: 201010280134.5 申请日: 2010-09-10
公开(公告)号: CN102399856A 公开(公告)日: 2012-04-04
发明(设计)人: 相建海;张晓军;郇聘;赵翠;李富花;王兵 申请(专利权)人: 中国科学院海洋研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;G01N21/64
代理公司: 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 代理人: 马驰
地址: 266071*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 bac dna 指纹 分析 标记 方法
【权利要求书】:

1.一种BAC DNA指纹分析的标记方法,其特征在于:

1)将BAC DNA样品采用限制性内切酶进行酶切,得酶切的BAC DNA片段;

2)采用一种荧光标记的dUTP和Taq DNA聚合酶对酶切后的BAC DNA片段进行标记,然后即可用于ABI测序仪上进行DNA片段分析。

2.按照权利要求1所述的标记方法,其特征在于:步骤1)将BAC DNA样品采用2-6种不同种类的限制性内切酶进行酶切,得酶切的BAC DNA片段。

3.按照权利要求2所述的标记方法,其特征在于:2-6种不同种类的限制性内切酶包括:1种4碱基识别位点的内切酶和1-5种6碱基识别位点的内切酶。

4.按照权利要求1所述的标记方法,其特征在于:步骤2)中的dUTP为Gold525dUTP。

5.按照权利要求1所述的标记方法,其特征在于:

1)BAC DNA的酶切和标记的具体过程为:

A.:在10μL浓度为0.5-1.5μg/μL BAC DNA样品中加入3μL酶切混合物(10×限制性内切酶buffer 1.3μl;100mg/mlBSA0.13μl;相应的2-6种不同种类的限制性内切酶每种1U;加超纯水补足3μl),混合均匀,37℃水浴放置酶切1.5-2.5h,置于冰上;

B.每样品加入7μL标记混合物(10×PCR buffer 2μl;25mM MgCl21.6μl;含有12.5μM Gold 525dUTP的dNTP混合物0.05μl;5U/μl TaqDNA聚合酶0.16μl;超纯水3.29μl),65℃水浴孵育45min-1.5h,置于冰上;

C.每样品加2μl的醋酸钠(5.2M,pH5.2)和70μl无水乙醇,混合均匀,置-80℃或-20℃放置30min;

D.3250-4000rpm 4℃离心30min沉淀DNA;

E.倒去上清,加0.2ml 70%冷乙醇4℃3250rpm离心二次,每次15min;

F.倒去上清后,DNA沉淀在超净台中干燥15-30min;

2)指纹分析检测:

在每个样品中加入9.85μL去离子甲酰胺和0.15μLSize Standard,在金属浴上95℃变性3-5min,然后按照操作要求在ABI系列测序仪上进行片段分析。

6.按照权利要求5所述的标记方法,其特征在于:该方法中所使用的dNTP混合物中的四种脱氧核糖核酸的摩尔比为dATP∶dGTP∶dCTP∶Gold 525dUTP=4∶4∶4∶1。

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