[发明专利]一种BAC DNA指纹分析的标记方法无效
申请号: | 201010280134.5 | 申请日: | 2010-09-10 |
公开(公告)号: | CN102399856A | 公开(公告)日: | 2012-04-04 |
发明(设计)人: | 相建海;张晓军;郇聘;赵翠;李富花;王兵 | 申请(专利权)人: | 中国科学院海洋研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 | 代理人: | 马驰 |
地址: | 266071*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 bac dna 指纹 分析 标记 方法 | ||
1.一种BAC DNA指纹分析的标记方法,其特征在于:
1)将BAC DNA样品采用限制性内切酶进行酶切,得酶切的BAC DNA片段;
2)采用一种荧光标记的dUTP和Taq DNA聚合酶对酶切后的BAC DNA片段进行标记,然后即可用于ABI测序仪上进行DNA片段分析。
2.按照权利要求1所述的标记方法,其特征在于:步骤1)将BAC DNA样品采用2-6种不同种类的限制性内切酶进行酶切,得酶切的BAC DNA片段。
3.按照权利要求2所述的标记方法,其特征在于:2-6种不同种类的限制性内切酶包括:1种4碱基识别位点的内切酶和1-5种6碱基识别位点的内切酶。
4.按照权利要求1所述的标记方法,其特征在于:步骤2)中的dUTP为Gold525dUTP。
5.按照权利要求1所述的标记方法,其特征在于:
1)BAC DNA的酶切和标记的具体过程为:
A.:在10μL浓度为0.5-1.5μg/μL BAC DNA样品中加入3μL酶切混合物(10×限制性内切酶buffer 1.3μl;100mg/mlBSA0.13μl;相应的2-6种不同种类的限制性内切酶每种1U;加超纯水补足3μl),混合均匀,37℃水浴放置酶切1.5-2.5h,置于冰上;
B.每样品加入7μL标记混合物(10×PCR buffer 2μl;25mM MgCl21.6μl;含有12.5μM Gold 525dUTP的dNTP混合物0.05μl;5U/μl TaqDNA聚合酶0.16μl;超纯水3.29μl),65℃水浴孵育45min-1.5h,置于冰上;
C.每样品加2μl的醋酸钠(5.2M,pH5.2)和70μl无水乙醇,混合均匀,置-80℃或-20℃放置30min;
D.3250-4000rpm 4℃离心30min沉淀DNA;
E.倒去上清,加0.2ml 70%冷乙醇4℃3250rpm离心二次,每次15min;
F.倒去上清后,DNA沉淀在超净台中干燥15-30min;
2)指纹分析检测:
在每个样品中加入9.85μL去离子甲酰胺和0.15μLSize Standard,在金属浴上95℃变性3-5min,然后按照操作要求在ABI系列测序仪上进行片段分析。
6.按照权利要求5所述的标记方法,其特征在于:该方法中所使用的dNTP混合物中的四种脱氧核糖核酸的摩尔比为dATP∶dGTP∶dCTP∶Gold 525dUTP=4∶4∶4∶1。
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