[发明专利]一种猪圆环病毒2型实时荧光定量PCR检测方法有效
| 申请号: | 201010271159.9 | 申请日: | 2010-08-31 |
| 公开(公告)号: | CN102382900A | 公开(公告)日: | 2012-03-21 |
| 发明(设计)人: | 赵凯;唐雪明;韩芳婷;邹勇;李春华;吴潇;朱宏;谭芙蓉;王金斌;蒋玲曦;陶世如;刘启文;施伟 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64 |
| 代理公司: | 上海开祺知识产权代理有限公司 31114 | 代理人: | 费开逵 |
| 地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 种猪 圆环 病毒 实时 荧光 定量 pcr 检测 方法 | ||
1.一种猪圆环病毒2型实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)首先设计与合成特异性上、下游引物和探针:所述上、下游引物的序列如SEQ ID No 1和SEQ ID No 2所示,具体如下:
上游引物 5′-CGGATATTGTAKTCCTGGTCGTA-3′,
下游引物 5′-CCTGTCCTAGATTCCCCTATTGATT-3′,
所述探针的序列如SEQ ID No 3所示,具体如下:
FAM-5′-CTAGGCCTACGTGGTCTACATTTC-3′-TAMRA;
2)目的片段的获得:配制PCR反应体系,按照PCR反应程序进行反应得到目的片段;
3)配制连接反应液;
4)转化并提取质粒模板;
5)定性PCR检测;
6)定量PCR检测。
2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述PCR反应体系为:2×PCR Mix 10-13μl,上下游引物各0.9-1.3μl,基因组DNA 1-2μl,去离子水补加至总体积25μl;所述PCR反应程序为:94℃5min,94℃1min,52℃1min,72℃1min,72℃10min,30-40循环。
3.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述连接反应液为2×快速连接缓冲液4-6μl,pGEM-T easy载体1μl,PCR产物1-3μl,T4连接酶1μl,补加去离子水至总体积10μl。
4.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述定性PCR检测的反应体系为10×buffer 2.0-3.0μl,25mM MgCl2 2μl,dNTP 2μl,上下游引物各0.9-1.3μl,1.25U DNA聚合酶,模板1-2μl,去离子水补加至总体积25μl;所述定性PCR检测的反应程序为:94℃5min,94℃30S,60℃20S,72℃20S,72℃7min,25-35循环。
5.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述定量PCR检测的反应体系为:10×buffer 2.5μl,25mM MgCl2 4.5μl,dNTP 2.5μl,上下游引物各0.9-1.3μl,探针0.1-1.0μl,1.25U DNA聚合酶,模板DNA 1μl,去离子水补加至总体积25μl;所述定量PCR检测的反应程序:94℃10min,94℃15S,60℃40S,40-50循环。
6.权利要求1所述的检测方法在制备荧光定量PCR试剂盒中的应用。
7.权利要求1所述的检测方法在快速和定量检测猪圆环病毒2型中的应用。
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