[发明专利]建立可控突变率突变库的方法与应用有效

专利信息
申请号: 201010242551.0 申请日: 2010-07-30
公开(公告)号: CN102345172A 公开(公告)日: 2012-02-08
发明(设计)人: 耿丽丽;束长龙;刘明;张杰;宋福平;黄大昉 申请(专利权)人: 中国农业科学院植物保护研究所
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06;C40B40/08;C12N15/31;C07K14/325;A01N63/02;A01P7/04
代理公司: 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 代理人: 胡敬红
地址: 100193 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 建立 可控 突变 方法 应用
【权利要求书】:

1.建立可控突变率突变库的方法,步骤如下:

A、确定突变条件:

(1)确定替换率:将起始模板进行梯度稀释,实时荧光定量PCR扩增,最低浓度的指数扩增最大循环数下可以得到最多的突变体;挑取最低浓度下的若干克隆测序,得到每个克隆平均突变碱基数,按式(I)计算替换率,

替换率=每个克隆平均突变碱基数/(突变目的片段碱基数×最大循环数);(I)

(2)确定预替换碱基数目所需的指数扩增循环数C1、C2、C3......,按式(II)计算:

循环数=预期替换碱基数目/(突变目的片段碱基数×替换率)(II)

其中C1、C2、C3分别代表预替换碱基数目为1、2、3时所需指数扩增循环数,

(3)确定所需起始模板量:实时荧光定量PCR扩增处于指数扩增的最大循环数与步骤(2)中确定的循环数C1、C2、C3......相比较,最接近的该PCR扩增所用模板量确定为所需起始模板量T1、T2、T3......

其中T1、T2、T3分别代表预替换碱基数目为1、2、3时PCT扩增所需起始模板量,

B、可控突变率突变库的建立:按照确定的循环数C1、C2、C3......和对应确定的起始模板量T1、T2、T3......,将起始模板PCR扩增得到可控突变率突变库L1、L2、L3......,所述L1、L2、L3分别代表平均替换碱基数为1、2、3的突变库。

2.根据权利要求1所述的建立可控突变率突变库的方法,所述起始模板为含有编码CrylIe蛋白的核苷酸片段的载体。

3.根据权利要求2所述的建立可控突变率突变库的方法,所述起始模板为含有编码CrylIe蛋白的核苷酸片段的质粒。

4.根据权利要求3所述的建立可控突变率突变库的方法,所述质粒为pAclIe,由pUC19克隆载体,crylAc启动子,crylIe基因全长组成。

5.根据权利要求4所述的建立可控突变率突变库的方法,所述预期替换碱基数目为1、2、3,可控突变率突变库为L1、L2、L3。

6.根据权利要求1-5任一所述方法得到的突变库L1、L2、L3......。

7.权利要求6所述的突变库中的突变体,所述突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO1,其氨基酸序列为SEQ IDNO12;

或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO2,其氨基酸序列为SEQ ID NO13;

或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO3,其氨基酸序列为SEQ ID NO14;

或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO4,其氨基酸序列为SEQ ID NO15;

或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO5,其氨基酸序列为SEQ ID NO16;

或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO6,其氨基酸序列为SEQ ID NO17;

或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO7,其氨基酸序列为SEQ ID NO18;

或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO8,其氨基酸序列为SEQ ID NO19;

或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO9,其氨基酸序列为SEQ ID NO20;

或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO10,其氨基酸序列为SEQ ID NO21;

或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO11,其氨基酸序列为SEQ ID NO22。

8.一个人工突变体,其氨基酸序列为将权利要求7的突变体中的任一两个以上氨基酸的替换位叠加后得到。

9.根据权利要求8所述的人工突变体,其氨基酸序列为SEQ ID NO24;其核苷酸序列为SEQ ID NO23,或者其氨基酸序列为SEQ ID NO26,核苷酸序列为SEQ ID NO25;其氨基酸序列为SEQ ID NO28,核苷酸序列为SEQ ID NO27。

10.权利要求7、8、9任一突变库中的突变体或是人工突变体在杀害鞘翅目害虫中的应用。

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