[发明专利]建立可控突变率突变库的方法与应用有效
申请号: | 201010242551.0 | 申请日: | 2010-07-30 |
公开(公告)号: | CN102345172A | 公开(公告)日: | 2012-02-08 |
发明(设计)人: | 耿丽丽;束长龙;刘明;张杰;宋福平;黄大昉 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C40B40/08;C12N15/31;C07K14/325;A01N63/02;A01P7/04 |
代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 胡敬红 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 建立 可控 突变 方法 应用 | ||
1.建立可控突变率突变库的方法,步骤如下:
A、确定突变条件:
(1)确定替换率:将起始模板进行梯度稀释,实时荧光定量PCR扩增,最低浓度的指数扩增最大循环数下可以得到最多的突变体;挑取最低浓度下的若干克隆测序,得到每个克隆平均突变碱基数,按式(I)计算替换率,
替换率=每个克隆平均突变碱基数/(突变目的片段碱基数×最大循环数);(I)
(2)确定预替换碱基数目所需的指数扩增循环数C1、C2、C3......,按式(II)计算:
循环数=预期替换碱基数目/(突变目的片段碱基数×替换率)(II)
其中C1、C2、C3分别代表预替换碱基数目为1、2、3时所需指数扩增循环数,
(3)确定所需起始模板量:实时荧光定量PCR扩增处于指数扩增的最大循环数与步骤(2)中确定的循环数C1、C2、C3......相比较,最接近的该PCR扩增所用模板量确定为所需起始模板量T1、T2、T3......
其中T1、T2、T3分别代表预替换碱基数目为1、2、3时PCT扩增所需起始模板量,
B、可控突变率突变库的建立:按照确定的循环数C1、C2、C3......和对应确定的起始模板量T1、T2、T3......,将起始模板PCR扩增得到可控突变率突变库L1、L2、L3......,所述L1、L2、L3分别代表平均替换碱基数为1、2、3的突变库。
2.根据权利要求1所述的建立可控突变率突变库的方法,所述起始模板为含有编码CrylIe蛋白的核苷酸片段的载体。
3.根据权利要求2所述的建立可控突变率突变库的方法,所述起始模板为含有编码CrylIe蛋白的核苷酸片段的质粒。
4.根据权利要求3所述的建立可控突变率突变库的方法,所述质粒为pAclIe,由pUC19克隆载体,crylAc启动子,crylIe基因全长组成。
5.根据权利要求4所述的建立可控突变率突变库的方法,所述预期替换碱基数目为1、2、3,可控突变率突变库为L1、L2、L3。
6.根据权利要求1-5任一所述方法得到的突变库L1、L2、L3......。
7.权利要求6所述的突变库中的突变体,所述突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO1,其氨基酸序列为SEQ IDNO12;
或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO2,其氨基酸序列为SEQ ID NO13;
或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO3,其氨基酸序列为SEQ ID NO14;
或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO4,其氨基酸序列为SEQ ID NO15;
或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO5,其氨基酸序列为SEQ ID NO16;
或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO6,其氨基酸序列为SEQ ID NO17;
或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO7,其氨基酸序列为SEQ ID NO18;
或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO8,其氨基酸序列为SEQ ID NO19;
或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO9,其氨基酸序列为SEQ ID NO20;
或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO10,其氨基酸序列为SEQ ID NO21;
或突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO11,其氨基酸序列为SEQ ID NO22。
8.一个人工突变体,其氨基酸序列为将权利要求7的突变体中的任一两个以上氨基酸的替换位叠加后得到。
9.根据权利要求8所述的人工突变体,其氨基酸序列为SEQ ID NO24;其核苷酸序列为SEQ ID NO23,或者其氨基酸序列为SEQ ID NO26,核苷酸序列为SEQ ID NO25;其氨基酸序列为SEQ ID NO28,核苷酸序列为SEQ ID NO27。
10.权利要求7、8、9任一突变库中的突变体或是人工突变体在杀害鞘翅目害虫中的应用。
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