[发明专利]HIV-1 O组(或亚组)逆转录病毒抗原的核苷酸序列

权利要求书

1.体外检测生物样品中HIV-1 O组病毒的感染方法，所述方法包括：

i)使所述样品在一定条件下与至少一种探针接触，其中所述探针衍生自或由HIV-1_(VAU)或HIV-1_(DUR)的env、gag或pol基因的至少100bp的片段组成，所述条件能够导致与O组HIV病毒的强杂交以及与M组HIV病毒的弱杂交，和

ii)检测所述探针和包含在所述生物样品中的核酸之间的分子杂交。

2.根据权利要求1的方法，其进一步包括，在所述检测之前，将探针/核酸复合物固定在适宜的固体支持物上以及用合适的洗涤溶液洗涤所述固体支持物。

3.根据权利要求1-2中任一项的方法，其中衍生自HIV-1_(VAU)或HIV-1_(DUR)的env、gag或pol基因的探针选自：

i)含有SEQ ID NO：5的序列；

ii)在高严紧条件下与SEQ ID NO：5特异性杂交的核酸；

iii)含有SEQ ID NO：7的序列；

iv)在高严紧条件下与SEQ ID NO：7特异性杂交的核酸；

v)513bp的gag基因的扩增序列，如SEQ ID NO：9所示；

vi)525bp的V3环序列，如SEQ ID NO：10所示；

vii)312bp的优势免疫区序列，如SEQ ID NO：11所示；

viii)通过引物4506(SEQ ID NO：1)和引物5011(SEQ ID NO：2)扩增的pol扩增子；

ix)通过引物TH2(SEQ ID NO：3)和引物UH2(SEQ ID NO：4)扩增的env基因扩增子；

x)编码SEQ ID NO：5的1至526位氨基酸且定义在SEQ ID NO：6中的核酸；

xi)编码SEQ ID NO：5的527至877位氨基酸且定义在SEQ ID NO：8中的核酸；

xii)扩增自HIV-1_(DUR)的gag扩增子，所述扩增子编码含有下列区域的肽：

a)SPRTLNAWVKAVEEKAFNPEIIPMFMALSEGA，

b)MLNAIGGHQGALQVLKEVIN，

c)GPLPPGQIREPTGSDIAGTTSTQQEQI，和

d)VGDIYRKWIVLGLNKMVKMYSPV。

4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中探针使经标记的。

5.根据权利要求4的方法，其中所述标记选自放射性标记、酶标记或荧光标记。

6.根据权利要求1-5中任一项所述的方法，其中所述的生物样品选自血液、血浆、血清、组织、细胞培养物或细胞提取物。

7.扩增自HIV-1_(DUR)的gag扩增子，所述扩增子编码含有下列区域的肽：

i)SPRTLNAWVKAVEEKAFNPEIIPMFMALSEGA，

ii)MLNAIGGHQGALQVLKEVIN，

iii)GPLPPGQIREPTGSDIAGTTSTQQEQI，和

iv)VGDIYRKWIVLGLNKMVKMYSPV。

8.产生肽或多肽的方法，其包括表达选自如下的分离的核酸：

i)含有SEQ ID NO：5的序列；

ii)在高严紧条件下与SEQ ID NO：5特异性杂交的核酸；

iii)含有SEQ ID NO：7的序列；

iv)在高严紧条件下与SEQ ID NO：7特异性杂交的核酸；

v)513bp的gag基因的扩增序列，如SEQ ID NO：9所示；

vi)525bp的V3环序列，如SEQ ID NO：10所示；

vii)312bp的优势免疫区序列，如SEQ ID NO：11所示；

viii)通过引物4506(SEQ ID NO：1)和引物5011(SEQ ID NO：2)扩增的pol扩增子；

ix)通过引物TH2(SEQ ID NO：3)和引物UH2(SEQ ID NO：4)扩增的env基因扩增子；

x)编码SEQ ID NO：5的1至526位氨基酸且定义在SEQ ID NO：6中的核酸；

xi)编码SEQ ID NO：5的527至877位氨基酸且定义在SEQ ID NO：8中的核酸；

xii)扩增自HIV-1_(DUR)的gag扩增子，所述扩增子编码含有下列区域的肽：

a)SPRTLNAWVKAVEEKAFNPEIIPMFMALSEGA，

b)MLNAIGGHQGALQVLKEVIN，

c)GPLPPGQIREPTGSDIAGTTSTQQEQI，和

d)VGDIYRKWIVLGLNKMVKMYSPV；和

Xiii)在i)至xii)中定义的探针之一的至少100bp片段。