[发明专利]一对大白菜芜菁花叶病毒病EST-SSR标记及其应用无效
申请号: | 201010180024.1 | 申请日: | 2010-05-24 |
公开(公告)号: | CN101838645A | 公开(公告)日: | 2010-09-22 |
发明(设计)人: | 李巧云;佟海申;张志刚;宋希云;赵智中;刘栓桃 | 申请(专利权)人: | 山东省农业科学院蔬菜研究所;青岛农业大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 济南诚智商标专利事务所有限公司 37105 | 代理人: | 王汝银 |
地址: | 250100 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一对 大白菜 芜菁 花叶 病毒 est ssr 标记 及其 应用 | ||
1.一对大白菜芜菁花叶病毒病EST-SSR标记,其特征是,其为一对等位标记ATA157和ATA154,与大白菜TuMV抗性位点间的连锁距离为3.8cM,其中,标记ATA157的片段长度为157bp,具有序列表SEQ ID No.1中的序列;标记ATA154的片段长度为154bp,具有序列表SEQ ID No.2中的序列。
2.用于扩增权利要求1所述的一对大白菜芜菁花叶病毒病EST-SSR标记的引物序列HCC259,其特征是,其上游引物为:GCAAAACGGAGTACCCTA;下游引物为:TTGGAAATGAAATGAGAAGA。
3.权利要求1所述的一对大白菜芜菁花叶病毒病EST-SSR标记的制备方法,其特征是:(1)采用改良CTAB法提取待测验单株的基因组DNA;(2)利用权利要求2所述的引物HCC259的上游引物和下游引物对步骤(1)获得的基因组DNA进行PCR扩增;(3)根据扩增结果,对照标准条带或通过测序,判断待测单株的抗、感特性,并推测其基因型。
4.如权利要求3所述的一对大白菜芜菁花叶病毒病EST-SSR标记的制备方法,其特征是,所述步骤(1)采用改良CTAB法提取待测验单株的基因组DNA的具体步骤为:取幼叶0.1g,在液氮中研成粉末,装入1.5mL离心管中;加入700μL 65℃预热的CTAB提取缓冲液,混匀,65℃水浴45min-1h,其间每5-10min摇一次;冷却至室温,离心取上清,用与所取上清液等体积的Tris饱和酚/氯仿/异戊醇抽提,所述酚:氯仿:异戊醇的体积比为25∶24∶1;摇匀后冰浴至分层;12000r/min离心10min,取上清液,用酚/氯仿/异戊醇再抽提一次,取上清液加入热处理的Rnase至终浓度100μg/mL,混匀后,37℃水浴45min;之后再次用酚/氯仿/异戊醇抽提,取上清,加入预冷的无水乙醇,-20℃保存30min,离心,倒掉上清,用70%的酒精清洗,室温吹干;加入TE溶解DNA,-20℃保存备用;用0.8%的琼脂糖电泳检测DNA质量完整性;所述CTAB提取缓冲液为质量体积比为2.0%的CTAB;1.4mol/L NaC1;1mol/L Tris-HCl,pH=8.0;0.5mol/L EDTA;体积比为1.0%的β-巯基乙醇。
5.如权利要求3或4所述的一对大白菜芜菁花叶病毒病EST-SSR标记的制备方法,其特征是,所述步骤(2)进行PCR扩增为:扩增采用20μL反应体系,其中,引物浓度0.75μmol·L-1,dNTPs 0.2mmol·L-1,Taq酶1.5U,模板DNA 75ng,含Mg2+的10×Buffer 2.0μL;反应程序为:94℃预变性4min,94℃变性1min,48.5℃退火45s,72℃延伸45s,共35个循环,72℃延伸10min,4℃保存;扩增产物在8%聚丙烯酰胺凝胶上检测,每孔点样6μL。
6.权利要求1所述的一对大白菜芜菁花叶病毒病EST-SSR标记在大白菜抗TuMV育种辅助选择方面的应用。
7.权利要求1所述的一对大白菜芜菁花叶病毒病EST-SSR标记在后代选择中区分纯合体和杂合体方面的应用。
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