[发明专利]油菜茎基溃疡病菌的实时荧光PCR检测方法及检测用引物和探针有效
申请号: | 201010142449.3 | 申请日: | 2010-04-08 |
公开(公告)号: | CN101805794A | 公开(公告)日: | 2010-08-18 |
发明(设计)人: | 易建平;尚琳琳;周国梁 | 申请(专利权)人: | 中华人民共和国上海出入境检验检疫局 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;G01N21/64 |
代理公司: | 上海浦一知识产权代理有限公司 31211 | 代理人: | 王函 |
地址: | 200135 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 油菜 溃疡 病菌 实时 荧光 pcr 检测 方法 引物 探针 | ||
1.一种油菜茎基溃疡病菌的实时荧光PCR检测方法,其特征在于, 包括如下步骤:
(1)设计引物和探针;
该引物的序列为:
Lmb3:5’-caccaattggatccccta-3’(SEQ ID NO.1)或其互补链;
R2:5’-ggcgcaaaatgtgctgcgct-3’(SEQ ID NO.2)或其互补链;
该探针的序列为:
Probe-M:5’-FAM-cacttgggactcgccttg-MGB-3’(SEQ ID NO.3)或其 互补链;
(2)对油菜籽样品进行过筛处理,然后收集油菜茎基溃疡病菌菌株的 菌丝并提取DNA;所述对油菜籽样品进行过筛处理具体为:用孔径2.5mm 和1.5mm的网筛过筛,取筛上物和筛下物,液氮研磨后取样提取DNA; 所述收集油菜茎基溃疡病菌菌株的菌丝并提取DNA具体为:菌株用PDA 培养基繁殖后收集菌丝,液氮研磨后取菌丝粉,用植物基因组提取试剂盒 提取DNA;
(3)采用步骤(1)设计的引物和探针进行实时荧光PCR检测。
2.如权利要求1所述的油菜茎基溃疡病菌的实时荧光PCR检测方法, 其特征在于,步骤(3)中,所述实时荧光PCR检测的反应体系为25μL, 包括12.5μL2×Premix Ex Taq、5μM步骤(1)设计的引物和探针各1μL、 1μL模板DNA、0.5μL 50×ROX Reference Dye II、加无菌水补至25μL。
3.如权利要求1或2所述的油菜茎基溃疡病菌的实时荧光PCR检测 方法,其特征在于,步骤(3)中,所述实时荧光PCR检测的反应程序为: 95℃预变性10s,然后以95℃15s,60℃1min进行40个循环。
4.一种用于检测油菜茎基溃疡病菌的引物,其特征在于,其序列为:
Lmb3:5’-caccaattggatccccta-3’(SEQ ID NO.1)或其互补链;
R2:5’-ggcgcaaaatgtgctgcgct-3’(SEQ ID NO.2)或其互补链。
5.一种用于检测油菜茎基溃疡病菌的探针,其特征在于,其序列为: Probe-M:5’-FAM-cacttgggactcgccttg-MGB-3’(SEQ ID NO.3)或其互补 链。
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