[发明专利]检测人K-ras基因外显子12、13突变的核苷酸序列、方法及试剂盒有效
| 申请号: | 201010120214.4 | 申请日: | 2010-03-09 |
| 公开(公告)号: | CN102010894A | 公开(公告)日: | 2011-04-13 |
| 发明(设计)人: | 熊慧 | 申请(专利权)人: | 上海源奇生物医药科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64 |
| 代理公司: | 北京元中知识产权代理有限责任公司 11223 | 代理人: | 王明霞 |
| 地址: | 201400 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 检测 ras 基因 外显子 12 13 突变 核苷酸 序列 方法 试剂盒 | ||
1.一种检测人K-ras基因外显子12、13突变的核苷酸序列,其特征在于,包含由SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:10所示的任一核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的检测人K-ras基因外显子12、13突变的核苷酸序列,其特征在于,SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列两端标记有JUP荧光集团,SEQ ID NO:4~10所示的核苷酸序列两端标记有MAR荧光集团。
3.根据权利要求1所述的检测人K-ras基因外显子12、13突变的核苷酸序列,其特征在于,所述核苷酸序列包含SEQ ID NO:1所示的上游引物、SEQ ID NO:2所示的下游引物、SEQ ID NO:3所示的野生型探和SEQ ID NO:4~SEQ ID NO:10所示的突变型探针中的至少一个。
4.根据权利要求1所述的检测人K-ras基因外显子12、13突变的核苷酸序列,其特征在于,所述核苷酸序列包含SEQ ID NO:1所示的上游引物、SEQ ID NO:2所示的下游引物、SEQ ID NO:3所示的野生型探针和SEQ ID NO:4~SEQ ID NO:10所示的突变型探针。
5.一种检测人K-ras基因外显子12、13突变的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取核酸样本;
(2)以步骤(1)提取的核酸为模板,用权利要求1至4任意一项所述的引物和探针序列,多重荧光PCR扩增病原体的靶核酸序列;
(3)采用荧光检测仪对扩增产物进行分析,并分析结果。
6.根据权利要求5所述的检测人K-ras基因外显子12、13突变的方法,其特征在于,所述的多重荧光PCR的反应体系为:50μL反应体系中含有:40μL反应体系中含有:2.5μL 10×PCR reaction buffer(Mg2+free),3mmol/L Mg2+,0.125mmol/L dNTP,0.25μmol/L上游引物,0.25μmol/L下游引物,0.125μmol/L野生型探针,0.125μmol/L突变型探针,Taq聚合酶2U,UNG酶0.2U,模板量为3μL,补充水至40μL。
7.根据权利要求6所述的检测人K-ras基因外显子12、13突变的方法,其特征在于,所述的PCR扩增条件为40~43℃5~8分钟、94~96℃3分钟预变性;92~94℃5秒、58~60℃30秒,重复30~35个循环;最后37℃保温。
8.根据权利要求8所述的检测人K-ras基因外显子12、13突变的方法,其特征在于,所述的PCR扩增条件为42℃5分钟、95℃3分钟预变性;94℃5秒、60℃50秒,重复32个循环;最后37℃保温。
9.一种检测人K-ras基因外显子12、13突变的试剂盒,其特征在于,含有权利要求1~5任一所述的引物和探针。
10.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒的组成为:
PCR反应液840μl,国际单位比为10∶1的Taq聚合酶和UNG酶的混合物48μl,阴性对照品20μl,阳性对照品I 20μl,阳性对照品II 20μl;
其中,PCR反应液的组成为:10×PCR缓冲液4ml,25mmol/L dNTP0.2ml,50μmol/L上游引物0.2ml,50μmol/L下游引物0.2ml,50μmol/L野生型探针0.1ml,50μmol/L突变型探针0.1ml,用纯化水定容至35ml,充分混匀;
阳性对照I和阳性对照II分别为Kras野生型和突变型质粒DNA溶液;
阴性对照品为纯化水。
11.检测人K-ras基因外显子12、13突变的试剂盒在表皮生长因子受体抗体药物临床用药方面的应用。
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