[发明专利]RNA合成-用于反向合成RNA的亚磷酰胺,以及在3’-末端合成RNA的配体、发色团和修饰物的方便引入中的应用在审
| 申请号: | 200980144136.7 | 申请日: | 2009-09-08 |
| 公开(公告)号: | CN102439025A | 公开(公告)日: | 2012-05-02 |
| 发明(设计)人: | S·C·斯里瓦斯塔瓦;S·P·巴杰帕伊;N·P·斯里瓦斯塔瓦;D·潘迪 | 申请(专利权)人: | 坎姆根公司 |
| 主分类号: | C07H21/02 | 分类号: | C07H21/02 |
| 代理公司: | 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 | 代理人: | 刘丹妮 |
| 地址: | 美国马*** | 国省代码: | 美国;US |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | rna 合成 用于 反向 亚磷酰胺 以及 末端 发色团 修饰 方便 引入 中的 应用 | ||
1.一种式(1)的亚磷酰胺,
其中,
Y为氧或硫;
W为氧、氮和氟;
R4选自叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、三异丙基甲硅烷基氧亚甲基、芴基甲基氧羰基(Fmoc)、烷基、芳基和乙酰基;
Z为由二甲氧基三苯基(DMT)、一甲氧基三苯基(MMT)和三甲氧基三苯基(TMT)组成的保护基;
R1为烷基或芳基;
R2为烷基或芳基;
R3为氰乙基,烷基或芳基;并且
B为氢或者任选地在各个伯胺上使用胺保护基官能化的核苷碱基。
2.一种式(1)的亚磷酰胺:
其中
Y为氧或硫;
W为硫;
R4为苯甲酰基,乙酰基或二硫化物;
Z为由二甲氧基三苯基(DMT)、一甲氧基三苯基(MMT)和三甲氧基三苯基(TMT)组成的保护基;
R1为烷基或芳基;
R2为烷基或芳基;
R3为氰乙基,烷基或芳基;并且
B为氢或者任选地在各个伯胺上使用胺保护基官能化的核苷碱基。
3.一种通过在5’-至3’-方向上成键来制备寡核苷酸的方法,所述方法用于合成选自以下结构式的RNA寡聚物:
所述方法包括将化合物
其中:
B为氢或者任选地在各个伯胺上使用胺保护基官能化的核苷碱基;
n为0至98;
Y为氧或硫;
W为氧、氮、硫或氟;
当W不为硫时,R4为甲硅烷基醚如TBDMS、三异丙基甲硅烷基氧亚甲基、Fmoc、烷基、芳基或者乙酰基;而当W为硫时,R4为苯甲酰基,乙酰基或二硫化物;
Z为DMT、MMT、TMT保护基;
R1和R2独立地选自烷基或芳基基团;
R3为氰乙基、烷基或者芳基;并且
M为氢自由基或Y-CO-;其中Y是适用于结合至固体载体的连接体。
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