[发明专利]RNA合成-用于反向合成RNA的亚磷酰胺,以及在3’-末端合成RNA的配体、发色团和修饰物的方便引入中的应用在审

专利信息
申请号: 200980144136.7 申请日: 2009-09-08
公开(公告)号: CN102439025A 公开(公告)日: 2012-05-02
发明(设计)人: S·C·斯里瓦斯塔瓦;S·P·巴杰帕伊;N·P·斯里瓦斯塔瓦;D·潘迪 申请(专利权)人: 坎姆根公司
主分类号: C07H21/02 分类号: C07H21/02
代理公司: 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 代理人: 刘丹妮
地址: 美国马*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: rna 合成 用于 反向 亚磷酰胺 以及 末端 发色团 修饰 方便 引入 中的 应用
【权利要求书】:

1.一种式(1)的亚磷酰胺,

其中,

Y为氧或硫;

W为氧、氮和氟;

R4选自叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、三异丙基甲硅烷基氧亚甲基、芴基甲基氧羰基(Fmoc)、烷基、芳基和乙酰基;

Z为由二甲氧基三苯基(DMT)、一甲氧基三苯基(MMT)和三甲氧基三苯基(TMT)组成的保护基;

R1为烷基或芳基;

R2为烷基或芳基;

R3为氰乙基,烷基或芳基;并且

B为氢或者任选地在各个伯胺上使用胺保护基官能化的核苷碱基。

2.一种式(1)的亚磷酰胺:

其中

Y为氧或硫;

W为硫;

R4为苯甲酰基,乙酰基或二硫化物;

Z为由二甲氧基三苯基(DMT)、一甲氧基三苯基(MMT)和三甲氧基三苯基(TMT)组成的保护基;

R1为烷基或芳基;

R2为烷基或芳基;

R3为氰乙基,烷基或芳基;并且

B为氢或者任选地在各个伯胺上使用胺保护基官能化的核苷碱基。

3.一种通过在5’-至3’-方向上成键来制备寡核苷酸的方法,所述方法用于合成选自以下结构式的RNA寡聚物:

所述方法包括将化合物

其中:

B为氢或者任选地在各个伯胺上使用胺保护基官能化的核苷碱基;

n为0至98;

Y为氧或硫;

W为氧、氮、硫或氟;

当W不为硫时,R4为甲硅烷基醚如TBDMS、三异丙基甲硅烷基氧亚甲基、Fmoc、烷基、芳基或者乙酰基;而当W为硫时,R4为苯甲酰基,乙酰基或二硫化物;

Z为DMT、MMT、TMT保护基;

R1和R2独立地选自烷基或芳基基团;

R3为氰乙基、烷基或者芳基;并且

M为氢自由基或Y-CO-;其中Y是适用于结合至固体载体的连接体。

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