[发明专利]先天性异常症的染色体缺失的检测方法

说明书

技术领域

本发明涉及伴有疾病的染色体缺失的检测方法，具体而言，是涉及通过对特定染色体区域的半合子缺失进行检测来辨别伴有精神发育迟滞的多发性畸形综合征的方法的发明。

背景技术

先天性异常综合征的患者大多数都被观察到染色体DNA的特定区域缺失。目前，基因组的缺失区域被明确的先天性异常综合征已知有很多。作为报告为以半合子缺失作为原因的疾病的先天性异常综合征的例子，例如已知有Williams综合征(7q11.2)、Smith-Magenis综合征(17p11.2)、Langer-Giedion综合征(8q24)、Wolf-Hirschhorn综合征(4p16.3)、Miller-Dieker综合征(17p13.3)、Prader-Willi and Angelman综合征(15q11-q13)、WAGR综合征(11p13)、Cri du Chat综合征(5p15.3)、Rubinstein-Taybi综合征(16p13.3)、毛发—鼻—指(趾)(Tricho-rhino-phalangeal)综合征(8q24.1)、Potoki-Shaffer综合征(11p11.2)、神经皮肤(Neurofibromatosis)I综合征(17q11)、Sotos综合征(5q35)、颅缝早闭(Craniosynostosis)综合征(7p21.1)、Kallmann type 1综合征(Xp22.3)、Kallmann type 2综合征(8p11.12)、Van der Woude综合征(1q32-q41)、ZFHX1B缺失综合征(2q22)、先天性睑裂狭小(Blepharophimosis ptosis and epicanthus inversus)综合征(3q23)、1p36综合征(1p36)、猫眼(Cat eye)综合征(22q11)、Alagille综合征(20p11.23)、Diamond-Blackfan综合征(19q13.2)、先天性肾上腺发育不全(Adrenal hypoplasia congenita)(Xp21.2)、Coffin-lowry综合征(Xp22.3)、DiGeorge综合征(22q11)、Russell-Silver综合征(7p11.2)、Duchenne肌萎缩(Xp21.2)等。(专利文献1：《基因组DNA的固着基底和使用了该基底的染色体异常及以此作为原因的疾病的检测方法(ゲノムDNAの定着基盤と当該基盤を用いた染色体異常並びにそれに起因する疾患の検出方法)》)。()内的标注表示这些综合征中半合子缺失的染色体区域。

另一方面，先天性异常综合征中有染色体DNA的特定区域扩增的例子。例如唐氏综合征中21号染色体形成三倍体，Pallister-Killian综合征中12号染色体短臂形成四倍体。Pelizaeus Merzbacher病(髓鞘形成障碍疾病)中Xq22区域的扩增是该病的原因。

但是，例如像成为本发明的判定对象的“伴有精神发育迟滞的多发性畸形综合征”那样，存在很多原因不明的先天性异常综合征。在这样的情况下，关于原因不明的疾病，对人基因组DNA进行无遗漏的分析，找出基因组DNA的缺失、扩增是非常有意义的。即，通过确定疾病原因存在于特定的基因组DNA，来对该疾病进行准确迅速的判定，可以进行正确的处置。另外，对成为该疾病的原因的基因组微细结构异常的鉴定成为可能，认为这也与将来的基因水平的治疗可能性有关。

专利文献1：特开2005-304481

非专利文献1：阵列CGH诊断活用指导手册(アレイCGH診断活用ガイドブツク)、稻泽让治·莳田芳男·羽田明编，p40～50和p78～81，株式会社医药杂志社2008年2月出版

发明内容

本发明是针对伴有精神发育迟滞的多发性畸形综合征的疾病，分析人染色体有无扩增或者缺失，明确其原因，提供该疾病的辨别方法。

本发明人为了发现能高效分析伴有精神发育迟滞的多发性畸形综合征(Multiple Congenital Anomaly-Mental Retardation)的基因组异常的方法，而进行了探讨。