[发明专利]癌症分期与治疗的系统和方法

说明书

相关申请

本申请要求2008年2月19日提交的美国临时申请61/029,656的优先权，该申请全部内容通过引用结合到本文中。

技术领域

本文提供了治疗癌症的方法，更具体地提供了基于微小RNA(microRNA)的基因表达对癌症进行差异治疗的方法。

背景技术

在世界范围内，肺癌是男性和女性中与癌症相关死亡率的主要原因。虽然对晚期非小细胞肺癌(NSCLC)的当前治疗令人失望，但使用抗血管新生治疗却越来越有希望。已经以非选择方式对患者进行了一些此类抗血管新生治疗，包括靶向VEGF受体2和3(VEGFR-2/3)的酪氨酸激酶抑制剂(TKI)，例如舒尼替尼和索拉非尼。

微小RNA(也称为miR或者miRNA)是长度在21到25个核苷酸的一类小的非编码RNA，其近来与癌症生物学相关联(Calin等，Proc Natl Acad Sci USA99：15524-15529，2002)。这些RNA片段通过与靶向mRNA的3’非翻译区(3’UTR)中的互补序列结合在转录后调控基因表达(Kumar等，Nat Genet39：673-677，2007)。这可最终导致蛋白质翻译的抑制并进而导致蛋白质表达的抑制(Eder等，N Eng J Med 352：2446-2448，2005)。由于miR的调节能力可极大影响细胞生理学，miR对蛋白质表达的调控正在成为癌变研究中的一个重要领域(Scott等，J Biol Chem 282：1479-1486，2007)。因此，需要通过miR表达预测个体患者中药效的方法。

发明内容

一方面，本发明提供了一种使用微小RNA评估肿瘤对酪氨酸激酶抑制剂敏感性的方法。

在一实施方案中，本发明提供了一种通过评估患者样品中miR-497的表达并将miR-497的降低表达与对酪氨酸激酶抑制剂的敏感性相关联来评估癌细胞对酪氨酸激酶抑制剂敏感性的方法。

在另一实施方案中，本发明提供了一种预测癌细胞对酪氨酸激酶抑制剂的敏感性从而对癌症治疗应用基于个性化药物的方法。

在另一实施方案中，本发明提供了一种预测癌细胞对酪氨酸激酶抑制剂的敏感性从而防止患者遭受可能无效的药物的副作用的方法。

在另一实施方案中，本发明提供了一种预测癌细胞对酪氨酸激酶抑制剂的敏感性从而防止癌症患者在可能无效的治疗上浪费时间的方法。

在另一实施方案中，本发明提供了一种评估肿瘤对酪氨酸激酶抑制剂敏感性的试验，所述试验不需要肿瘤活检。

在一实施方案中，患者样品来自血液。在另一实施方案中，患者样品来自肿瘤活检。

在另一实施方案中，通过mRNA检测方法例如RT-PCR、微阵列分析、或Northern印迹法来评估表达。

在另一实施方案中，酪氨酸激酶抑制剂特异性地抑制：仅VEGFR2、仅VEGFR3、VEGFR2和VEGFR3两者、或者与任何其他分子组合的VEGFR2或VEGFR3。在一实施方案中，酪氨酸激酶抑制剂为舒尼替尼。在另一实施方案中，酪氨酸激酶抑制剂为索拉非尼。

在另一实施方案中，所述癌细胞为非小细胞肺癌细胞。

在另一方面，本发明提供了一种涉及减缓癌细胞群扩散的方法，该方法包括：评估样品中miR-497的表达，将miR-497的降低表达与对酪氨酸激酶抑制剂的敏感性相关联，以及使用酪氨酸激酶抑制剂治疗所述癌细胞群。

在一实施方案中，本发明提供了一种将miR-497的阳性表达与对酪氨酸激酶抑制剂的抗性相关联的方法。在这种情况下，不施用酪氨酸激酶抑制剂。

在一实施方案中，样品取自人。在另一实施方案中，所述样品为血液组分。在另一实施方案中，所述样品为肿瘤活组织。

在一实施方案中，显示癌细胞在染色体区域17p呈现杂合度缺失。

在一实施方案中，癌细胞为非小细胞肺癌细胞。

在一实施方案中，酪氨酸激酶抑制剂特异性地抑制：仅VEGFR2、仅VEGFR3、VEGFR2和VEGFR3两者、或者与任何其它分子组合的VEGFR2或VEGFR3。

在另一实施方案中，酪氨酸激酶抑制剂为舒尼替尼。

在另一实施方案中，所述癌细胞群包含非小细胞肺癌细胞。

在另一方面，本发明提供了有助于评估miR-497表达的试剂盒，所述试剂盒包括一种能够特异性识别miR-497自身或miR-497基因产物的试剂。在一实施方案中，所述试剂包含寡核苷酸。在另一实施方案中，所述试剂包含反义核酸。在另一实施方案中，所述试剂与固体支持物结合。