[发明专利]同时对人21及18号染色体数目进行检测的方法无效
申请号: | 200910194364.7 | 申请日: | 2009-12-03 |
公开(公告)号: | CN102086469A | 公开(公告)日: | 2011-06-08 |
发明(设计)人: | 孙筱放;眭建忠 | 申请(专利权)人: | 广州医学院第三附属医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 广州三环专利代理有限公司 44202 | 代理人: | 刘宇峰 |
地址: | 510150 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 同时 21 18 染色体 数目 进行 检测 方法 | ||
1.一种同时对人21及18号染色体数目进行检测的方法,其特征在于,包括以下步骤:
A.样品DNA提取:
按常规苯酚-氯仿法提取样本的DNA,检测DNA浓度及纯度;
B.引物设计和合成:
选择21号染色体21q21.3上的淀粉样前蛋白基因部分片段和18号染色体18p11.32上的胸苷酸合成酶基因部分片段,设计相应引物,使得两基因部分片段在同一管中相互作为内参照同时扩增;并设计相应的Taqman探针,探针3′端标记非荧光性的淬灭基因Eclipse,5′端标记FAM或HEX荧光基团;
其中,针对21号染色体设计的上游引物序列为SEQ ID NO.1,下游引物序列为SEQ ID NO.2,相应的Taqman探针序列为SEQ ID NO.3;针对18号染色体设计的上游引物序列为SEQ ID NO.4,下游引物序列为SEQ IDNO.5,相应的Taqman探针序列为SEQ ID NO.6;
C.多重实时荧光PCR扩增反应:
采用25ul反应体系,包含:模板DNA 2ul(60ng),两对引物各300nmol/L,相应TaqMan荧光探针各200nmol/L,1×TaqMan通用PCR混合试剂12.5ul;该混合试剂中含有热启动DNA聚合酶、dNTP、MgCl2、荧光染料ROX;
每个DNA标本进行3个平行管的扩增;
热循环条件为:50℃2分钟,95℃10分钟,然后95℃15秒,60℃1分钟,循环40次;
D.相对定量分析方法:
采用ABI7500型PCR仪随机附带软件进行荧光相对定量分析;
分析参数设定:阈值线设在对数期并超过无规则噪音线的最高处,不同批次采用同一阈值分析,将阈值设定为0.2;基线范围起点为第3个循环,终点为第19个循环;
仪器附带软件根据设定参数自动计算出CT值,APP基因部分片段的扩增产物与TYMS基因部分片段的扩增产物CT值之差为相对定量指标ΔCT值,取3个平行管ΔCT值的平均值;通过ΔCT值来确定21及18号染色体的数目。
2.一种同时对人21及18号染色体数目进行检测的试剂盒,包括多重荧光PCR反应液、热启动DNA聚合酶、dNTP、MgCl2、荧光染料ROX,其特征在于,还包括:两对引物和相应的Taqman荧光探针;
所述第一对引物和相应的探针是针对21号染色体21q21.3上的淀粉样前蛋白基因部分片段设计的,包括:序列为SEQ ID NO.1的上游引物,序列为SEQ ID NO.2的下游引物;以及序列为SEQ ID NO.3的相应Taqman探针;
所述第二对引物和相应的探针是针对18号染色体18p11.32上的胸苷酸合成酶基因部分片段设计的,包括:序列为SEQ ID NO.4的上游引物,序列为SEQ ID NO.5的下游引物,以及序列为SEQ ID NO.6的相应Taqman探针;
探针3′端标记非荧光性的淬灭基因Eclipse,5′端标记FAM或HEX荧光基团。
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