[发明专利]UGT1A1基因多态性检测的方法及液相芯片有效
| 申请号: | 200910193155.0 | 申请日: | 2009-10-19 | 
| 公开(公告)号: | CN101671740A | 公开(公告)日: | 2010-03-17 | 
| 发明(设计)人: | 许嘉森;何嘉英;杨惠夷 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 | 
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 | 
| 代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 | 代理人: | 万志香;曾旻辉 | 
| 地址: | 510663广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 | 
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | ugt1a1 基因 多态性 检测 方法 芯片 | ||
1.一种UGT1A1基因多态性检测液相芯片,其特征是,主要包括有:
(1).分别包被有特异的对应野生型和变异型的anti-tag序列的微球,所述anti-tag序列选 自针对UGT1A1*28基因型的SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.14、针对UGT1A1*6基因型的SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10、和/或针对UGT1A1*93基因型的SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12,上 述每种微球具有不同颜色编码;
(2).扩增出具有UGT1A1*28、UGT1A1*6和/或UGT1A1*93基因型的变异目标序列的引物,所 述引物具有生物素修饰,以使对应的PCR反应产物含有生物素标记,且所述PCR反应产物具有 能与anti-tag互补配对的序列;所述扩增引物的碱基序列为针对UGT1A1*28和UGT1A1*6基因型 的SEQ ID NO.15及SEQ ID NO.16;和/或针对UGT1A1*93基因型的SEQID NO.17及SEQ ID NO.18; 上述每对引物中的一条的末端具有生物素修饰。
2.根据权利要求1所述的UGT1A1基因多态性检测液相芯片,其特征是,还包括有对应野生型和 变异型的ASPE引物对,每种ASPE引物由3’端的针对检测的不同基因型目的基因位点的特异性 引物序列和5’端的tag序列组成,所述特异性引物序列分别为针对UGT1A1*6基因型的SEQ ID NO.5及SEQ ID NO.6,和/或针对UGT1A1*93基因型的SEQ ID NO.7及SEQ ID NO.8,所述tag 序列能与微球上相应的anti-tag序列互补配对。
3.根据权利要求1所述的UGT1A1基因多态性检测液相芯片,其特征是,主要包括有
(1).分别包被有特异的对应野生型和变异型的anti-tag序列的微球,所述anti-tag序列选 自针对UGT1A1*28基因型的SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.14、针对UGT1A1*6基因型的SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10、和针对UGT1A1*93基因型的SEQID NO.11和SEQ ID NO.12,上述 每种微球具有不同颜色编码;
(2).扩增出具有UGT1A1*28和UGT1A1*6基因型的变异目标序列的一对引物SEQ ID NO.15及 SEQ ID NO.16,和扩增出具有UGT1A1*93基因型的变异目标序列的一对引物SEQID NO.17及SEQ ID NO.18;每对引物中的一条的末端具有生物素修饰;
(3).对应野生型和变异型的ASPE引物对,所述ASPE引物对分别为针对UGT1A1*6基因型SEQ ID NO.1及SEQID NO.2,和针对UGT1A1*93基因型的SEQ ID NO.3及SEQ ID NO.4。
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