[发明专利]在微阵列上检测未指定的遗传修饰生物体

权利要求书

1.一种用于检测样品中未指定的遗传修饰生物体(GMO)存在的方法，所述方法包括以下步骤：

(1)可能地从样品提取遗传元件，其包括整合到GMO的基因组中的外源核苷酸序列的至少一部分，

(2)检测样品中一种或多种共有遗传元件核苷酸序列的存在或缺乏，其包括筛选和/或属于整合到GMO的基因组中的所述部分的基因特异性序列的存在或缺乏，优选选自：P35S、T-Nos、Pnos-nptII、bla、nptII、Pat、Bar、Cry1Ab、Cry3Bb1和EPSPS核苷酸序列，

(3)检测样品中一种或多种事件特异性遗传元件核苷酸序列的存在或缺乏，

(4)鉴定来自检测步骤(2)和/或(3)的、样品中存在的所有指定GMO的存在或缺乏，

(5)关联步骤(2)中检测到的每种共有遗传元件与样品中存在的以及步骤(4)中鉴定的所述指定GMO，

(6)当步骤(2)中检测到的至少一种共有遗传元件与样品中鉴定的任何指定GMO不相关时，推断样品中存在未指定的GMO。

2.权利要求1的方法，其包含对于每种指定的GMO至少60％，优选80％，更优选100％的事件特异性元件。

3.权利要求1-2的方法，其中事件特异性遗传元件是边缘片段。

4.权利要求1的方法，其中当至少一个检测到的共有遗传元件不存在于遗传图谱中时，该遗传图谱表明指定GMO的共有遗传元件的存在，在样品中检测到未指定的GMO。

5.权利要求1的方法，其中共有遗传元件核苷酸序列选自：P35S、T-Nos、Pnos-nptII、bla、nptII、Pat、Bar、Cry1Ab、Cry3Bb1和EPSPS核苷酸序列。

6.权利要求1-4中任一项的方法，其中事件特异性遗传元件(核苷酸序列)包括位于GMO的事件特异性遗传元件核苷酸序列的插入点两侧的至少5个核苷酸。

7.权利要求1-6中任一项的方法，其中指定GMO包括至少5个，优选至少8个或所有选自如下的指定GMO：BT176、Mon810、Bt11、Mon863、GA21、Mon603、RRS、GT73、T45、Mon1445、Mon531、Mon15985、Mon863X Mon810、Mon863XMon603、Mon603X Mon810、GA21X Mon810、Mon531X Mon1445、Mon15985XMon1445、TC1507、Topas 19/2、H7-1、T25、DAS59122、TC1507X Mon603、MS8X RF3、MS1X RF1、MS1X RF2、优选至少RRS、MON810、Bt11、MON531和T25、或更优选至少RRS、MON810、Bt11、MON531、MON15985、MON1445、T25和Bt176。

8.权利要求1的方法，其中在相同的分析中进行步骤(2)和(3)。

9.权利要求1-8中任何一项的方法，其中遗传元件在通过PCR扩增以后进行检测，而且优选在检测存在的遗传元件核苷酸序列(步骤2和/或步骤3)期间进行定量，并推断GMO的丰度。

10.权利要求9的方法，其中用于共有遗传元件PCR扩增的引物是用于在至少2个不同的指定GMO中同源的元件的所述扩增的通用引物。

11.权利要求1-10的任一项的方法，其中样品中指定GMO的鉴定包括：

-遗传元件核苷酸序列的PCR扩增，优选使用加尾引物，然后使用与所述尾巴相同的或互补的第二引物，和

-在微阵列上检测扩增的遗传元件。