[发明专利]一种联合检测五种烈性病原菌的基因液相芯片及其检测方法有效

专利信息
申请号: 200910078811.2 申请日: 2009-03-04
公开(公告)号: CN101560557A 公开(公告)日: 2009-10-21
发明(设计)人: 王静;孙肖红;杨宇;文海燕;刘衡川;胡孔新 申请(专利权)人: 中国检验检疫科学研究院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04;G01N21/64;C12R1/07;C12R1/01
代理公司: 北京中创阳光知识产权代理有限责任公司 代理人: 尹振启
地址: 100025北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 联合 检测 烈性 病原菌 基因 芯片 及其 方法
【权利要求书】:

1.一种联合非诊断性检测多种病原体的方法,其特征在于,该方法使 用液相芯片,所述芯片包括微球、捕获探针、生物素化的引物、PCR反 应体系、链亲和素-藻红蛋白,所述病原体为炭疽芽孢杆菌、鼠疫耶尔森 菌、土拉弗朗西斯菌、布鲁菌和类鼻疽博克霍尔德菌;其中,使用的引 物序列如下:

炭疽芽孢杆菌:两对引物,其中一对位于染色体一对位于质粒,序列如 下:

BA-1-F:TGGACGCATACGAGACATAAT

BA-1-R:TGCTTTAGCGGTAGCAGAGG

BA-2-F:TTTCATAATCATGGATTTCCCG

BA-2-R:TTACCCAACATCATCTTCGCA

鼠疫耶尔森菌:位于染色体,序列如下,

YP-F:ACTCAATGTTGTGACGAGGATG

YP-R:TTACTTCTAATGCCATCAGGTAGC

布鲁菌:序列如下,

Bru-F:TGGCTCGGTTGCCAATATCAA

Bru-R:GCGCTTGCCTTTCAGGTCTG

土拉热弗朗西丝菌:fopA,序列如下,

FT-F:GGGCAAATCTAGCAGGTCAAG

FT-R:GCTGTAGTCGCACCATTATCCT

类鼻疽博克霍尔德菌:序列如下

BP-F:CGATCTCGTCAAGGTGTCGG

BP-R:CCCCAGTTCATCTGATACTTGC

使用所述引物对所述病原体进行多重PCR扩增,然后加入扩增的PCR 产物,使微球上的捕获探针捕获相应的PCR产物,再与链亲和藻红蛋白反 应后进行探测,该方法中所用捕获探针序列如下:

炭疽菌探针1:GAAGAACGCAGGCTTAGATTGGT

炭疽菌探针2:CTCGCTTTCATCGCATTTCTCCC

鼠疫菌探针:AACAGTAAGCATCCAGTCGTTCATA

布鲁菌探针:TTACGCAGTCAGACGTTGCCTAT

土拉菌探针:TGCTGGTTTAACATGGTTCTTTGG

类鼻疽菌探针:AGGTCAATTTCCCGAACAAGACT。

2.如权利要求1所述的非诊断性检测方法,其特征在于,所述的PCR反 应体系包括10×PCR缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶、生物素化的引物、 去离子水。

3.如权利要求1-3任一项所述的非诊断性检测方法,其特征在于,该 方法包括步骤:

1)、待检测样本核酸的提取;

2)、多重PCR反应,配制一定组分浓度的30μl PCR反应体系;

3)、捕获探针捕获PCR产物:将偶联有探针的微球与生物素化标记的多 重PCR产物混合,在95℃变性5~10分钟,45~60℃杂交10~30分钟,探 针即可特异性捕获对应的PCR产物,然后再加入链亲和素-藻红蛋白。

4.如权利要求1所述的非诊断性检测方法,其特征在于,在引物合成时 将序列5’端进行生物素标记。

5.如权利要求1-3任一项所述的非诊断性检测方法,其特征在于,在 所述的PCR体系中,引物对的浓度分别为60-150nmol/L。

6.如权利要求6所述的非诊断性检测方法,其特征在于,在所述的PCR 体系中,dNTPs的浓度为0.05-0.5μmol/L。

7.如权利要求1-3所述的非诊断性检测方法,其特征在于,在所述的 PCR体系中,Taq酶浓度为1-5U/30μl。

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