[发明专利]一种联合检测五种烈性病原菌的基因液相芯片及其检测方法有效
| 申请号: | 200910078811.2 | 申请日: | 2009-03-04 |
| 公开(公告)号: | CN101560557A | 公开(公告)日: | 2009-10-21 |
| 发明(设计)人: | 王静;孙肖红;杨宇;文海燕;刘衡川;胡孔新 | 申请(专利权)人: | 中国检验检疫科学研究院 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;G01N21/64;C12R1/07;C12R1/01 |
| 代理公司: | 北京中创阳光知识产权代理有限责任公司 | 代理人: | 尹振启 |
| 地址: | 100025北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 联合 检测 烈性 病原菌 基因 芯片 及其 方法 | ||
1.一种联合非诊断性检测多种病原体的方法,其特征在于,该方法使 用液相芯片,所述芯片包括微球、捕获探针、生物素化的引物、PCR反 应体系、链亲和素-藻红蛋白,所述病原体为炭疽芽孢杆菌、鼠疫耶尔森 菌、土拉弗朗西斯菌、布鲁菌和类鼻疽博克霍尔德菌;其中,使用的引 物序列如下:
炭疽芽孢杆菌:两对引物,其中一对位于染色体一对位于质粒,序列如 下:
BA-1-F:TGGACGCATACGAGACATAAT
BA-1-R:TGCTTTAGCGGTAGCAGAGG
BA-2-F:TTTCATAATCATGGATTTCCCG
BA-2-R:TTACCCAACATCATCTTCGCA
鼠疫耶尔森菌:位于染色体,序列如下,
YP-F:ACTCAATGTTGTGACGAGGATG
YP-R:TTACTTCTAATGCCATCAGGTAGC
布鲁菌:序列如下,
Bru-F:TGGCTCGGTTGCCAATATCAA
Bru-R:GCGCTTGCCTTTCAGGTCTG
土拉热弗朗西丝菌:fopA,序列如下,
FT-F:GGGCAAATCTAGCAGGTCAAG
FT-R:GCTGTAGTCGCACCATTATCCT
类鼻疽博克霍尔德菌:序列如下
BP-F:CGATCTCGTCAAGGTGTCGG
BP-R:CCCCAGTTCATCTGATACTTGC
使用所述引物对所述病原体进行多重PCR扩增,然后加入扩增的PCR 产物,使微球上的捕获探针捕获相应的PCR产物,再与链亲和藻红蛋白反 应后进行探测,该方法中所用捕获探针序列如下:
炭疽菌探针1:GAAGAACGCAGGCTTAGATTGGT
炭疽菌探针2:CTCGCTTTCATCGCATTTCTCCC
鼠疫菌探针:AACAGTAAGCATCCAGTCGTTCATA
布鲁菌探针:TTACGCAGTCAGACGTTGCCTAT
土拉菌探针:TGCTGGTTTAACATGGTTCTTTGG
类鼻疽菌探针:AGGTCAATTTCCCGAACAAGACT。
2.如权利要求1所述的非诊断性检测方法,其特征在于,所述的PCR反 应体系包括10×PCR缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶、生物素化的引物、 去离子水。
3.如权利要求1-3任一项所述的非诊断性检测方法,其特征在于,该 方法包括步骤:
1)、待检测样本核酸的提取;
2)、多重PCR反应,配制一定组分浓度的30μl PCR反应体系;
3)、捕获探针捕获PCR产物:将偶联有探针的微球与生物素化标记的多 重PCR产物混合,在95℃变性5~10分钟,45~60℃杂交10~30分钟,探 针即可特异性捕获对应的PCR产物,然后再加入链亲和素-藻红蛋白。
4.如权利要求1所述的非诊断性检测方法,其特征在于,在引物合成时 将序列5’端进行生物素标记。
5.如权利要求1-3任一项所述的非诊断性检测方法,其特征在于,在 所述的PCR体系中,引物对的浓度分别为60-150nmol/L。
6.如权利要求6所述的非诊断性检测方法,其特征在于,在所述的PCR 体系中,dNTPs的浓度为0.05-0.5μmol/L。
7.如权利要求1-3所述的非诊断性检测方法,其特征在于,在所述的 PCR体系中,Taq酶浓度为1-5U/30μl。
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