[发明专利]用于检测耐药微生物的方法

说明书

相关专利申请的交叉引用

本专利申请要求提交于2007年8月13日的美国临时专利申请No.60/964,499的优先权，该专利申请以引用的方式并入本文。

背景技术

肠球菌属细菌是存在于自然界、动物和人类体内的革兰氏阳性球菌。肠球菌是人类正常胃肠道和生殖道细菌群落的一部分。在已知的菌种中，人体内最主要的是粪肠球菌(80-90％)和屎肠球菌(5％至10％)。肠球菌通常不是人体内的病原体；但它们显示出增加的多种药物抗性水平(Kaufhold and Klein，1995，Zentralblatt.Fuer.Bakterilogie.，282(4)：507-518；Svec et al.，1996，Epidemiologie MikrobiologieImunologie，45：153-157)(Kaufhold和Klein，《细菌学文摘》1995年第282(4)期第507-518页；Svec等人，《流行病学、微生物学、免疫学》1996年第45期第153-157页)，并且已经被越来越多地看作导致医院感染的重要原因。粪肠球菌感染包括尿路感染(UTI)、菌血症、心内膜炎、以及伤口和腹盆部感染，占所有尿路感染的16％和所有菌血症的8％。

耐万古霉素肠球菌(VRE)已经被看作导致医院感染的第二大常见原因，仅次于大肠杆菌。耐药性可通过染色体介导(内在)或质粒或转座子介导(获得)。VRE的特征在于对几乎全部现有的抗生素具有耐药性，其中包括万古霉素，而万古霉素被看作是有效抵抗革兰氏阳性菌的“终极”抗生素。内科医生可以选择的治疗方案是有限的，其中包括抗菌剂的组合使用或使用新的未经证实疗效的化合物。患者可能在没有症状的情况下移植和携带VRE，主要移植部位为肛门、腋窝、粪便、会阴、肚脐、伤口、导尿管、以及结肠造口术部位。

粪肠球菌质粒介导的vanA是赋予高水平万古霉素耐药性的基因，它可以体外转移至若干革兰氏阳性微生物，例如金黄色葡萄球菌(Leclercq et al.，1989，Antimicrob.Agents Chemother.33：10-15；Noble etal.，1992，FEMS Microbiology Letters，72：195-198)(Leclercq等人，《抗微生物制剂和化学治疗》1989年第33期第10-15页；Noble等人，《欧洲微生物学会联合会微生物学快报》1992年第72期第195-198页)。据报道，万古霉素在临床分离金黄色酿脓葡萄球菌、链球菌属、迟缓埃格特菌和无害梭菌时表现出耐药性，并且万古霉素耐药性最有可能从耐万古霉素肠球菌获得(Centers for Disease Control andPrevention.2002.Morb.Mortal.Wkly.Rep.，51：565-567；Centers forDisease Control and Prevention.2002，Morb.Mortal.Wkly.Rep.51：902；Weigel et al.，2003，Science，302：1569-1571；Weigel et al.，2007，Antimicrob.Agents Chemother.，51：231-238；Mevius et al.，1998，J.Antimicrob.Chemother.，42：275-276；Poyart et al.，1997，Antimicrob.Agents Chemother.，41：24-29；Stinear et al.，2001，Lancet，357：855-856)(疾病预防控制中心，《发病率与死亡率周报》2002年第51期第565-567页；疾病预防控制中心，《发病率与死亡率周报》2002年第51期第902页；Weigel等人，《科学》2003年第302期第1569-1571页；Weigel等人，《抗微生物制剂和化学治疗》2007年第51期第231-238页；Mevius等人，《抗微生物和化学疗法杂志》1998年第42期第275-276页；Poyart等人，《抗微生物制剂和化学治疗》1997年第41期第24-29页；Stinear等人，《柳叶刀》2001年第357期第855-856页)。

发明内容

人们对于涉及耐药微生物早期鉴别和治疗性介入的诊断工具有着持续的需求。