[发明专利]前列腺癌存活和复发

说明书

相关申请

本申请要求2007年2月23日申请的美国临时专利申请60/891,477的优先权(2008年2月23日(周六)是其12个月的期限)，通过引用将其纳入本文，就好像全文列出那样。

技术领域

本发明设计鉴定和使用与前列腺癌临床相关的基因(或序列)表达的概况或模式。具体说，本发明基于鉴定其表达与患者存活，前列腺癌复发和/或出现前列腺癌转移相关联的基因或表达序列。体现为核酸表达，蛋白质表达或其他表达形式的基因表达概况可用于预测患有前列腺癌的对象的存活，预测前列腺癌复发和/或预测前列腺癌转移的出现。该概况也可用于研究和/或诊断前列腺癌细胞和组织，以及研究和/或确定患者的预后。用于诊断或预后时，根据预期寿命，癌症复发和/或癌症转移的概率，用该概况确定前列腺癌的治疗。

背景技术

前列腺癌是美国男性中最常诊断出的癌症，每年约有240,000例新诊断的患者和40,000例癌症死亡。由于在分子和遗传水平对该癌症欠缺了解并且对其天然疾病过程缺乏理解，临床上难以诊断和控制前列腺癌。

前列腺癌研究受限于可用于研究的前列腺癌组织标本来源不足，特别是病理学良好表征，为进行RNA和蛋白质研究而适当保存以及与患者临床，病例和随访信息相关联的标本。

用手术治疗一些前列腺癌病例。然而，一部分患者治疗失败。这可通过化学失败(术后1年PSA上升)或发生转移(常见于淋巴结和骨)进行判断。鉴定或预测术后患者是否可能出现PSA失败，前列腺癌复发和/或发生转移的能力将为患者带来多项益处。

发明内容

本发明包括鉴定和使用在临床上与前列腺癌有关的基因(或序列)表达模式(或概况或″签名″)。体现为核酸表达，蛋白质表达或其他表达形式的基因表达概况可用于预测患有前列腺癌的对象的前列腺癌复发和/或存活。在涉及使用前列腺切除术的实施方式中，本发明包括预测前列腺癌复发，癌症转移或PSA水平升高复发的可能性的方法。

一方面，本发明包括鉴定，然后使用能提供与前列腺癌有关的预后信息的基因(或序列)表达概况的方法。该表达概况与癌症复发，癌症转移和/或存活后果情况良好或不良的患者相关联(因此能够区分这些患者)。在一些实施方式中，本发明包括在患有前列腺癌的对象中鉴定与癌症复发和/或转移相关的表达概况的方法。在其他实施方式中，本发明包括将患者的前列腺癌细胞样品中基因(或序列)表达与经鉴定的表达概况作比较的方法，以确定患者在，例如前列腺切除术后的可能后果。优选使用本发明的这些实施方式以满足重要而未满足的诊断需求，以便能够预测患者是否可能得益于手术治疗前列腺癌，或者患者采用另一类治疗是否更好或是否需要除手术外的辅助治疗。

可能获益于根治性前列腺切除术的患者的一个非限制性例子是通过患者前列腺癌细胞的表达概况(如本文所述)预测术后癌症不会复发和/或不会转移的患者。以相关方式，预测不会从手术获益的患者的非限制性例子是通过患者前列腺癌细胞的表达概况(如本文所述)预测术后会发生癌症转移的患者。例如，前列腺癌的复发可以是在相同部位，而转移常常出现在不同的部位或组织，例如但不限于淋巴结或骨。

在其他实施方式中，提供了将具有前列腺癌细胞的患者群体中，或在前列腺切除术后的患者鉴定为，相对于另一亚群属于癌症复发和/或存活后果更好(例如复发或转移风险较低)的患者亚群的方法，或相对于另一亚群属于癌症复发和/或存活后果较差(例如复发或转移风险升高)的患者亚群的方法。因此，该方法能够将患者分成至少两个亚群或亚型。

本发明包括通过测定本文所述的表达模式将前列腺癌患者(任选在前列腺癌切除术后)鉴定为可能具有较好或较差的癌症复发，癌症转移和/或存活后果的非主观手段。因此，以前用主观解释(例如根据免疫组化染色和主观分析)确定前列腺癌患者或前列腺切除术后患者的预防和/或治疗，本发明引入了客观的表达模式，客观表达模式可单用或与其他(主观和/或客观)标准联用以便更准确地评价患者后果，包括存活和癌症的复发或转移。因此，本发明的表达模式包括确定前列腺癌或前列腺癌切除术后预后的手段。

本发明的表达模式包括能够较为精确地区别前列腺癌或前列腺切除术后的后果的一种以上基因或表达序列。经鉴定，该基因或表达序列的表达水平与后果相关联，以使该表达水平可用于确定患者的优选治疗方案。因此，本发明包括通过测定所述对象的含前列腺癌细胞的样品中与本文所述患者后果相关的表达水平来确定患有前列腺癌，任选是前列腺癌切除术后的对象的后果的方法。