[发明专利]一种采用核酸连接酶进行单核苷酸多态性检测的方法及试剂盒无效

专利信息
申请号: 200810039223.3 申请日: 2008-06-19
公开(公告)号: CN101608214A 公开(公告)日: 2009-12-23
发明(设计)人: 樊春海;万莹;张炯;宋世平 申请(专利权)人: 苏州市长三角系统生物交叉科学研究院有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;G01N27/00
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 代理人: 徐 迅
地址: 215128江苏省苏州*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 采用 核酸 连接酶 进行 核苷酸 多态性 检测 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种检测待测核酸第x位碱基的单核苷酸多态性的方法,其特征在于,所述方法包括:

(a)提供一种芯片,所述的芯片包括:基片,所述的基片表面是一金属基面,其上具有区域1,区域2,区域3,和/或区域4,其中,

区域1固定有游离端末端碱基是A的捕获探针,

区域2固定有游离端末端碱基是T的捕获探针,

区域3固定有游离端末端碱基是C的捕获探针,

区域4固定有游离端末端碱基是G的捕获探针,

其中,当所述捕获探针的游离端为3端时,与所述末端碱基相邻的5-100bp碱基与所述待测核酸第x位碱基之后且与该第x位碱基相邻的5-100bp碱基特异性互补;当所述捕获探针的游离端为5端时,与所述末端碱基相邻的5-100bp碱基与所述待测核酸第x位碱基之前且与该第x位碱基相邻的5-100bp碱基特异性互补;

(b)将待测核酸、信号探针和核酸连接酶加样于所述芯片的区域1,区域2,区域3和区域4,进行连接反应;

其中,当所述捕获探针的游离端为3端时,所述信号探针的序列自5端起的5-100bp碱基与待测核酸第x位碱基之前且与该第x位碱基相邻的5-100bp碱基特异性互补,且所述的信号探针的3末端连接有电流反应检测信号;当所述捕获探针的游离端为5端时,所述信号探针的序列自3端起的5-100bp碱基与待测核酸第x位碱基之后且与该第x位碱基相邻的5-100bp碱基特异性互补,且所述的信号探针的5末端连接有电流反应检测信号;

(c)对(b)的芯片上的核酸进行变性处理,去除非固定于基片的核酸链和未反应的信号探针;

(d)电化学法检测(c)获得的芯片上区域1,区域2,区域3,和/或区域4的电流反应检测信号,

若电流反应检测信号位于区域1,则待测核酸第x位碱基是T;

若电流反应检测信号位于区域2,则待测核酸第x位碱基是A;

若电流反应检测信号位于区域3,则待测核酸第x位碱基是G;

若电流反应检测信号位于区域4,则待测核酸第x位碱基是C;

其中,x为11-1000000的正整数。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的金属基面上每一区域具有测定电流反应用电极。

3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的金属基面上还固定有具有通式(I)结构的化学分子:

HS-(CH2)n-(OC2H5)m-R    (I);

其中,R选自:OH,H,OCH3,CH3,OC2H5,C2H5,OCH2COOH,NH2

m为选自0-12的正整数;

n为选自3-15的正整数。

4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的金属选自:金,铂,钯或银。

5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(b)中,所述的电流反应检测信号是特异性催化电流反应的酶,并且步骤(d)的检测过程包括:

将所述特异性催化电流反应的酶的底物和/或电子传递媒介加样于区域1,区域2,区域3,和/或区域4;检测各区域产生的电流反应信号,从而确定电流反应检测信号的存在区域。

6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(b)中,所述的电流反应检测信号是酶联免疫可偶联分子,并且步骤(d)的检测过程包括:

将“酶联免疫可偶联分子的偶联物-特异性催化电流反应的酶”复合物加样于区域1,区域2,区域3,和/或区域4,从而在酶联免疫可偶联分子末端偶联上“酶联免疫可偶联分子的偶联物-特异性催化电流反应的酶”;

将所述特异性催化电流反应的酶的底物和/或电子传递媒介加样于区域1,区域2,区域3,和/或区域4;检测各区域产生的电流反应信号,从而确定电流反应检测信号的存在区域。

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