[发明专利]利用水稻DNA插入或缺失分子标记鉴定籼稻和粳稻的方法有效
| 申请号： | 200810037114.8 | 申请日： | 2008-05-08 |
| 公开（公告）号： | CN101323878A | 公开（公告）日： | 2008-12-17 |
| 发明（设计）人： | 卢宝荣;蔡星星 | 申请（专利权）人： | 复旦大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司： | 上海正旦专利代理有限公司 | 代理人： | 陆飞;盛志范 |
| 地址： | 20043*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 利用 水稻 dna 插入 缺失 分子 标记 鉴定 籼稻 粳稻 方法 | ||
【权利要求书】：
1.一种利用插入或缺失分子标记鉴定籼稻和粳稻的方法，其特征在于具体步骤如下：
(1)从水稻植株的任何器官或组织提取DNA样品；
(2)用34对特异引物对对提取的水稻DNA样品进行PCR扩增；
(3)电泳检测PCR产物；
(4)计算基因频率：
根据PCR产物的电泳结果和读取记录电泳结果中样品在各特异位点上的基因型结 果，使用下述公式来计算样本各特异位点的平均籼稻型基因频率Fi或粳稻型基因频率Fj， 其变化在0-100％之间：
籼稻型基因频率(％)：
粳稻型基因频率(％)：
式中：Xii为样本某一特异位点的纯合籼稻基因型，
Xjj为样本某一特异位点的纯合粳稻基因型，
Xij为样本某一特异位点的籼-粳稻杂合基因型，
N为使用引物对的数目；
(5)确定籼稻和粳稻：
根据检测样品中各特异位点的平均基因频率Fi或Fj，确定水稻样品为籼稻或粳稻， 具体判断标准如下：
；
所述的34对特异引物列表如下：
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