[发明专利]通过酶联免疫吸附方法检测小分子RNA芯片的方法无效
申请号: | 200810033313.1 | 申请日: | 2008-01-31 |
公开(公告)号: | CN101497920A | 公开(公告)日: | 2009-08-05 |
发明(设计)人: | 阮康成;李巍 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海生命科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N33/535 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 | 代理人: | 范 征 |
地址: | 20003*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 通过 免疫 吸附 方法 检测 分子 rna 芯片 | ||
技术领域
本发明属于生物技术领域,更具体地,本发明涉及一种通过酶联免疫吸附方法检测小分子RNA(miRNA)芯片的方法。
背景技术
近年来,microRNA作为调控基因的一个大类渐渐被人们所熟知。microRNA广泛的存在于多细胞生物中,并且在发育调节,细胞凋亡,细胞增殖,应急反应等诸多生物过程中起着重要的调节作用。面对种类繁多的miRNA,基因芯片凭借其微量、快速、大规模平行检测等优势,在miRNA的研究中发挥着越来越重要的作用。
目前检miRNA的技术主要采用miRNA表达谱检测技术,常用的研究方法是miRNA的克隆和Northern杂交。通过克隆特异生物样品的miRNA不但可以发现新的miRNA,而且miRNA被克隆的频率也反映其丰度。Northern杂交可以比克隆更为精确地反映miRNA表达谱,是研究miRNA表达谱的常规方法。但是,Northern杂交一次只能研究一种miRNA在不同组织或器官中的分布,而且不同miRNA的Northern杂交不可比较。Northern杂交和克隆的方法一样,都非常费时费力,而且还要应用放射性同位素标记。
寡核苷酸芯片技术是一种微量、快速、大规模平行检测mRNA表达谱的技术,它通过探针设计,使得其所有探针在同一杂交条件下可以特异性地与相应的mRNA结合。反应时总RNA或者带poly(A)的总mRNA通过荧光标记引物(oligo(T)或随机引物)或者反转录过程中掺入荧光标记的方法标记cDNA,然后与芯片杂交进行检测。只需要微量的样品,就可以平行的检测所有的microRNA在组织,细胞中的表达情况。然而miRNA表达谱的检测不同于mRNA表达谱的检测之处在于miRNA与mRNA相比太短,难以进行探针设计,而且序列上没有象mRNA一样的poly(A)尾巴,不能象mRNA一样可以用荧光标记的oligo(T)进行反转录标记。所以,荧光标记是miRNA芯片的一个难点。现有技术中所用的miRNA荧光标记方法各不相同,或者采用通过随机引物反转录标记miRNA的cDNA的方法,或者采用RT-PCR的方法标记miRNA正义链,或者采用直接标记miRNA的荧光标记方法。相应于标记的方法的不同,探针也有所不同。
综上可见,现有的miRNA芯片大多基于荧光标记技术,芯片的检测需要昂贵的荧光扫描仪,限制了miRNA芯片的广泛应用,尤其是在临床检测中的应用。因此本领域迫切需要开发简便有效且低成本的检测miRNA芯片的方法。
发明内容
本发明的目的就是提供一种简便有效且低成本的检测miRNA芯片的方法。
在本发明的第一方面,提供一种检测RNA样品中待测miRNA的方法,所述方法包括:
(a)将RNA样品加样于miRNA芯片,所述miRNA芯片上固定有对应于(如与待测miRNA互补)待测miRNA的探针,所述RNA样品携带酶联免疫可检测信号;从而使得待测核酸样品中的miRNA与miRNA芯片上相应的探针结合,在芯片上形成“酶联免疫可检测信号-miRNA-探针”复合物;和
(b)利用酶联免疫法检测“酶联免疫可检测信号-miRNA-探针”复合物中的酶联免疫可检测信号,从而确定RNA样品中待测miRNA的存在与否以及存在的量。
在另一优选例中,所述的酶联免疫可检测信号是生物素或其类似物。
在另一优选例中,步骤(b)包括:
(b1)用所述酶联免疫可检测信号的偶联物与“酶联免疫可检测信号-miRNA-探针”复合物反应,所述酶联免疫可检测信号的偶联物是亲和素或其类似物,且该偶联物上携带酶标记物;从而在芯片上形成“酶标记物-偶联物-酶联免疫可检测信号-miRNA-探针”复合物;
(b2)利用所述酶标记物对应的底物与“酶标记物-偶联物-标记物-miRNA-探针”复合物反应,从而确定待检测样品中待测miRNA的存在与否以及存在的量。
在另一优选例中,所述的酶标记物选自(但不限于):辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶。
在另一优选例中,所述的酶标记物对应的底物选自(但不限于):用于碱性磷酸酶的对硝基苯磷酸酯(p-nitrophenyl phosphate,p-NPP)或5-溴-4-氯-3-吲哚-磷酸/硝基四氮唑蓝(BCIP/NBT);或用于辣根过氧化物酶的邻苯二胺(OPD)、四甲基联苯胺(TMB)或2,2’-连氮-双-〔3-乙基苯并噻唑啉磺酸〕(ABTS)。
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