[发明专利]一种检测ADPRT基因多态性的检测方法及试剂盒无效
申请号: | 200810027882.5 | 申请日: | 2008-05-01 |
公开(公告)号: | CN101570778A | 公开(公告)日: | 2009-11-04 |
发明(设计)人: | 夏昭林;缪文彬;张忠彬 | 申请(专利权)人: | 夏昭林;缪文彬;张忠彬 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200032上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 adprt 基因 多态性 方法 试剂盒 | ||
1、一种检测ADPRT基因多态性的检测方法,其特征在于该检测方法包括以下步骤:
a、以人基因组DNA为模板,在ADPRT基因位点所在区域设计基因序列正、反向引物,通过单碱基错配在正向引物引入一个酶切位点,并对模板基因组DNA进行特异性PCR扩增;
b、利用限制性内切酶对其进行酶切;
c、根据琼脂糖凝胶电泳对上述ADPRT基因进行片段大小分离,确定其基因多态性;
其中所述的ADPRT基因位点为Val762A1a(rs1136410),所述的正向引物为:5’-TTTTGCTCCTCCAGGCCAAC*G-3’(*前的碱基为引入的错配碱基以创造酶切位点);所述的反向引物为:5’-CCTGACCCTGTTACCTTAATGTCAGTTTT-3’。
2、根据权利要求1所述的检测方法,其中步骤a中所述的PCR扩增为在25μl反应体系下,94℃预变性5min后,进行30个如下循环扩增:94℃变性40s,57℃退火40s,72℃延伸35s,最后72℃延伸5min。
3、根据权利要求2所述的检测方法,其中所述的25μl反应体系包括:1U Taq DNA聚合酶,10×Buffer 2.5μl,25mol/L MgCl2 2μl,2.5mmol/L dNTPs 2.5μl,50ng人基因组DNA,10μmol/L上下游引物各1μl,由灭菌超纯水补足25μl。
4、根据权利要求1所述的检测方法,其中步骤b中所述的限制性内切酶为20μl Bsh1236I酶切体系,所述的20μl Bsh1236I酶切体系包括:10μl的PCR扩增产物,10U/μl的Bsh1236I限制性内切酶1μl,10×缓冲液2μl和7μl灭菌超纯水。
5、一种检测ADPRT基因多态性的试剂盒,该试剂盒包括扩增用的基因特异性引物、dNTPs、用于PCR反应的DNA聚合酶及其缓冲液,用于RFLP的限制性内切酶Bsh1236I和相应的缓冲液。
6、根据权利要求5所述的试剂盒,该试剂盒包括:
正向引物为:5’-TTTTGCTCCTCCAGGCCAAC*G-3’;
反向引物为:5’-CCTGACCCTGTTACCTTAATGTCAGTTTT-3’;
1U Taq DNA聚合酶;
10×Buffer 2.5μl;
25mol/L MgCl22μl;
2.5mmol/L dNTPs 2.5μl;
10μmol/L上下游引物各1μl。
10单位Bsh1236I酶;
2μL的酶切缓冲液。
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