[发明专利]一种口腔致病菌的多重PCR快速检测方法无效
申请号: | 200810015998.7 | 申请日: | 2008-05-14 |
公开(公告)号: | CN101270381A | 公开(公告)日: | 2008-09-24 |
发明(设计)人: | 肖水清;刘晓华;刘毅;张体勇 | 申请(专利权)人: | 肖水清 |
主分类号: | C12Q1/04 | 分类号: | C12Q1/04;C12Q1/68 |
代理公司: | 济南金迪知识产权代理有限公司 | 代理人: | 宁钦亮 |
地址: | 250001山东省济南*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 口腔 致病菌 多重 pcr 快速 检测 方法 | ||
1、一种口腔致病菌多重PCR快速检测方法,其特征在于,采用多重PCR扩增口腔致病菌中的伴放线放线杆菌、福塞类杆菌、具核梭杆菌和牙龈卟啉单胞菌的特异基因,再通过电泳检测特异基因。
2、如权利要求1所述的多重PCR快速检测方法,其特征在于,所述多重PCR扩增口腔中的伴放线放线杆菌、福塞类杆菌、具核梭杆菌和牙龈卟啉单胞菌的特异基因,包括如下步骤:
1)采用热裂解法提取DNA模板,具体步骤如下:
挑取待测菌置于200μl裂解缓冲液中,100℃水浴10min,取3μl清液,即得模板DNA,留存备用;
2)多重PCR扩增伴放线放线杆菌、福塞类杆菌、具核梭杆菌和牙龈卟啉单胞菌的特异基因,具体步骤如下:
反应体系:总体积为25μl
H2O 14.25μl,
缓冲液(10×PCR) 2.5μl,
MgCl2(25mM) 2μl,
dNTP(0.2μM) 1μl,
引物混合液(10μM) 2μl,
DNA聚合酶(0.5U) 0.25μl,
模板DNA 3μl;
引物:
伴放线放线杆菌、福塞类杆菌、牙龈卟啉单胞菌的下游引物为共有引物:
5’-ACGTCATCCCCACCTTCCTC-3’ (引物1);
伴放线放线杆菌的上游引物为:5’-ATTGGGGTTTAGCCCTGGTG-3’ (引物2);
福塞类杆菌的上游引物为:5’-TACAGGGGAATAAAATGAGATACG-3’ (引物3);
牙龈卟啉单胞菌的上游引物为:5’-TGTAGATGACTGATGGTGAAAACC-3’ (引物4);
具核梭杆菌的上游引物为:5’-CAAATGCTTGTGTCAATAATACT-3’ (引物5);
具核梭杆菌的下游引物为:5’-TTTAGAAATGGTAGAATA AT-3’ (引物6);
PCR反应循环参数为:
94℃ 5min;94℃ 30sec、55℃ 30sec、72℃ 40sec,30个循环;72℃延伸7min;
吸取14.25μl无菌去离子水加至微离心管中,再依次加入10×PCR缓冲液2.5μl,25mMMgCl2 2μl,0.2μM dNTP1μl,10μM引物混合液2μl,0.5U DNA聚合酶0.25μl,模板DNA 3μl,将微离心管置于离心机,10000转/分离心混匀1分钟,再将微离心管放入PCR仪中,按照设定的参数进行PCR扩增反应;制得特异基因溶液;
3)电泳检测鉴定
对上述特异基因溶液进行电泳检测,电泳图中含有长度为360bp、745bp、500bp或197bp相应特征位置条带的一种或多种,分别对应于样本含有伴放线放线杆菌、福塞类杆菌、具核梭杆菌、牙龈卟啉单胞菌的一种或多种。
3、如权利要求2所述的多重PCR快速检测方法,其特征在于,所述步骤1)中的裂解缓冲液为:1.0mmol/L EDTA,1.0%Triton X-100,10mmol/L Tris-HCl,pH8.0。
4、如权利要求2所述的多重PCR快速检测方法,其特征在于,所述步骤3)电泳检测鉴定的具体操作方法如下:
以TAE缓冲液配制2%(w/v)琼脂糖凝胶溶液,加热溶解,待冷却至50~60℃时,加入溴化乙锭,使溴化乙锭终浓度为1μg/ml,充分混匀,倒入胶膜中,放好梳子,待胶凝固后,移去梳子,将凝胶放入电泳槽中,加入TAE缓冲液,使液面高出凝胶表面1~2mm;再将PCR扩增后的特异基因溶液与TAE缓冲液以1∶10体积比混合,用微量移液器将样品依次加入加样孔内,盖上电泳槽并通电,80V恒压电泳,使DNA向阳极方向移动,电泳25~35min后,切断电源,取出凝胶,在紫外光下观察。
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