[发明专利]通过对薄切肿瘤组织中mRNA表达进行定量测试实体瘤中药物敏感性的方法

说明书

背景

技术领域

本发明涉及检验瘤组织对治疗药物敏感性的方法，特别地，涉及对在所述 方法中从薄切活体肿瘤组织获得的细胞中促细胞凋亡标记物mRNA的表达进 行定量。

相关技术的描述

针对患者“定制”、“个性化”或“个体化”的药物是最近提出的新理念用 于为每个患者鉴定适当的个体化治疗(参见Jain KK，分子治疗学研究进展 (Curr Opin Mol Ther)4，548(2002)，这里并入作为参考)。对于癌症患者，这 是特别重要的，因为已知化学治疗药物会诱导严重的副作用。然而，目前的药 物选择依赖于通过使用大量患者的双盲临床试验所得到的统计上显著性结果。 在进行诊断时，患者经历了统计上证实的标准治疗而不考虑在药物敏感性方面 的个体差异。尽管已经进行了各种尝试来预测这些药物应答，当目前仍没有可 以利用的通用方法，主要是由于两个主要的原因：1)一旦在体外从外科手术 移出的组织或活组织检查样品分离癌细胞，则癌细胞的特征可能不均一；和2) 通常培养条件不能模拟正常的生理环境。尽管基因组DNA中的单核苷酸多态 性(SNP)提供了某些线索用于鉴定对特定药物的敏感或不敏感的患者(参见 A.Di Paolo，R.Danesi，M.Del Tacca，药理学研究(Pharmacol.Res.)49，331 (2004)，这里并入作为参考)，但这些信息不能通用于所有药物。此外，即使已 经鉴定出影响对特定药物应答的SNP，但仍不知道是否还未被鉴定出的第二或 第三种SNP会补偿、抵消或加剧对药物应答的改变。

发明内容

在一个实施方式中，公开了一种确定治疗药物是否针对实体瘤可能有效的 方法，所述方法包括：从所述实体瘤获得第一样品和第二样品，其中所述第一 样品和第二样品含有厚度为20微米至500微米基本均一的切片；在体外将第 一样品与所述药物孵育；在体外将所述第二样品与对照刺激物孵育；在孵育之 后，检测所述第一样品和第二样品中与肿瘤细胞凋亡相关的mRNA的量；以 及将所述第一样品和第二样品中所述mRNA的量进行比较，其中如果所述量 有超过大约50％的差别，则所述治疗可能有效。在进一步的方面中，所述基本 均一的切片具有在大约50微米至200微米范围内的厚度。在进一步的方面中， 所述第一样品和第二样品各自含有至少三个均一的切片。在进一步的方面中， 所述对照刺激物选自由PBS和DMSO所组成的组中。在进一步的方面中，将 所述第一样品和第二样品孵育在CO₂孵育器中。在进一步的方面中，所述第 一样品和第二样品被孵育3小时至5小时。在进一步的方面中，所述第一样品 和第二样品被孵育大约4小时。在进一步的方面中，如果所述第一样品中所述 mRNA的量高于所述第二样品中所述mRNA的量，则所述治疗可能是有效的。 在进一步的方面中，将所述第一样品和第二样品中所述mRNA的量进行比较 包括确定所述第一样品中该mRNA的量与所述第二样品中该mRNA的量的比 值，如果该比值是1.5或更高，则所述治疗可能是有效的。在进一步的方面中， 如果该比值为2.0或更高，则所述治疗可能是有效的。在进一步的方面中，所 述治疗药物包括选自由柔红霉素、阿霉素、阿糖胞苷、顺铂、依托泊苷和米托 蒽醌(mitoxantron)所组成组中的药物。