[发明专利]预测杜克氏B结肠癌复发的分子检测无效
申请号: | 200780015953.3 | 申请日: | 2007-03-05 |
公开(公告)号: | CN101437962A | 公开(公告)日: | 2009-05-20 |
发明(设计)人: | Y·王;A·马祖姆德;Y·姜;T·布里格斯 | 申请(专利权)人: | 维里德克斯有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 | 代理人: | 郭文洁;刘 玥 |
地址: | 美国新*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 预测 杜克氏 结肠癌 复发 分子 检测 | ||
发明背景
本发明涉及基于生物样品基因表达概况(expression profiles)对 结直肠癌的预后。
结直肠癌是一种具有复杂起源的异质性疾病。接受结直肠癌治疗 的患者,其复发的可能性与肿瘤穿透通过肠壁的程度以及是否累及淋 巴结(nodal involvement)相关。这些特性是目前通过杜克氏分类所确定 的疾病分期系统的基础。杜克氏A疾病限于结肠或直肠的粘膜下层。 杜克氏B肿瘤侵入穿过固有肌层并能穿透结肠或直肠壁。杜克氏C 疾病包括具有局部淋巴结转移的任何程度的肠壁侵入。
外科切除术对于结直肠癌早期非常有效,在杜克氏A患者中提 供了95%的治愈率以及在杜克氏B患者中提供了75%的治愈率。杜 克氏C疾病中出现阳性淋巴结,则预测在5年内有60%的复发可能 性。杜克氏C患者术后化疗疗程治疗降低复发率至40%-50%,现今 成为杜克氏C患者的监护标准。由于相对低的复发率,在杜克氏B 中术后化疗的益处愈发难以检测,因此留存争议。然而,杜克氏B 分类并不完善,约20-30%的患者行为表现更像杜克氏C,并且在5 年时间范围内复发。
显然需要鉴定出比淋巴受累更好的预后因子,用于指导将哪些杜 克氏B划入可能复发的,哪些划入将生存的。Rosenwald等.(2002); Compton等.(2000);Ratto等.(1998);Watanabe等.(2001);Noura等. (2002);Halling等.(1999);Martinez-Lopez,等.(1998);Zhou等. (2002);Ogunbiyi等.(1998);Shibata等.(1996);Sun等.(1999);和 McLeod等.(1999)。通过鉴定更可能需要且可能受益于辅助疗法的患 者,利用这些信息制定更好的规划。Johnston(2005);Saltz等.(1997); Wolmark等.(1999);International multicenter pooled analysis of B2colon cancer trials(IMPACT B2)investigators:Efficacy of adjuvant fluorouracil and folinic acid in B2colon cancer(International multicenter pooled analysis of B2 colon cancer trials(IMPACT B2)investigators: Efficacy of adjuvant fluorouracil and folinic acid in B2 colon cancer) (1999);和Mamounas等.(1999)。
由于发现及初步验证研究已完成,基因组学在诊断和治疗癌症中 的临床应用就获得了动力。Allen等.(2005a);Allen等.(2005b);Van’t Veer等.(2002);Van de Vijver等.(2002);Wang等(2005);Beer等. (2002);和Shipp等.(2002)。随着更多研究的公开,人们也逐渐增加了 对于在一般临床实践上推行这些标记所面临的挑战。最近,Ransohoff (2005)和Simon等.(2003)描述了有关分子标志评价消除偏倚以及关 键方面的规则。已明确的关于分子特征(molecular signature)能在 更广的范围被接受的必要条件在于对真实独立的患者群体的检测性 能的确认。另外的限制是基于DNA微阵列的检测需要新鲜冷冻的组 织样品。结果,这些检测不容易在诸如冷冻的石蜡包埋(FPE)组织样品 之类的标准的临床材料中应用。
在已公开的美国专利申请20050048526、20050048494、 20040191782、20030186303和20030186302以及Wang等.(2005)中 公开了用于结肠癌的基因表达概况预后。本说明书提供了用于测定基 因表达概况的材料和方法。
发明概述
本发明提供了用于评价患者结直肠癌复发可能性的材料和方法, 所述患者被诊断为结直肠癌或已接受针对结直肠癌的治疗。该方法包 括分析基因表达概况。
在本发明的一个方面中,基因表达概况包括用于检测至少7种特 定基因表达的引物和探针。
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