[发明专利]预测杜克氏B结肠癌复发的分子检测

权利要求书

1.一种确定预测杜克氏B结肠癌复发的方法，包括步骤：

a.从患者获得肿瘤样品；和

b.测定选自下列编码mRNA的基因在样品中的表达水平：

i.相应于SEQ ID Nos：7-28；或

ii.为相应于SEQ ID Nos 29-79和94-97至少之一的引物和/ 或探针所识别的；或

iii.通过至少一种选自SEQ ID NOs：5-6、80-93的扩增子的 产生所鉴定的；

其中基因表达水平超过或低于预定的截断值指示预测杜克氏B结肠 癌复发。

2.一种确定患者治疗方案的方法，包括步骤：

a.从患者获得肿瘤样品；和

b.测定选自下列编码mRNA的基因在样品中的表达水平：

i.相应于SEQ ID Nos：7-28；或

ii.为相应于SEQ ID Nos 29-79和94-97至少之一的引物和/ 或探针所识别的；或

iii.通过至少一种选自SEQ ID NOs：5-6、80-93的扩增子的 产生所鉴定的；

其中基因表达水平超过或低于预定的截断值足以指示复发风险，由此 能使医师确定用于预防复发的治疗的程度和类型的相关建议。

3.一种确定患者治疗方案的方法，包括步骤：

a.从患者获得肿瘤样品；和

b.测定选自下列编码mRNA的基因在样品中的表达水平：

i.相应于SEQ ID Nos：7-28；或

ii.为相应于SEQ ID Nos 29-79和94-97至少之一的引物和/ 或探针所识别的；或

iii.通过至少一种选自SEQ ID NOs：5-6、80-93的扩增子的 产生所鉴定的；

其中基因表达水平超过或低于预定的截断值足以指示复发风险，由此 能使医师确定用于预防复发的治疗的程度和类型的相关建议。

4.一种治疗患者的方法，包括步骤：

a.从患者获得肿瘤样品；和

b.测定选自下列编码mRNA的基因在样品中的表达水平：

i.相应于SEQ ID Nos：7-28；或

ii.为相应于SEQ ID Nos 29-79和94-97至少之一的引物和/ 或探针所识别的；或

iii.通过至少一种选自SEQ ID NOs：5-6、80-93的扩增子的 产生所鉴定的；

c.如果他们是高风险患者，利用辅助疗法治疗患者。

5.一种治疗患者的方法，包括步骤：

a.从患者获得肿瘤样品；和

b.测定选自下列编码mRNA的基因在样品中的表达水平：

i.相应于SEQ ID Nos：7-28；或

ii.为相应于SEQ ID Nos 29-79和94-97至少之一的引物和/ 或探针所识别的；或

iii.通过至少一种选自SEQ ID NOs：5-6、80-93的扩增子的 产生所鉴定的；和

c.如果他们是高风险患者，利用辅助疗法治疗患者。

6.权利要求1-5任一项的方法，其中样品获得自原发肿瘤。

7.权利要求1、2或4的方法，其中制备物获得自活组织检查或 外科手术样品。

8.权利要求1-5任一项的方法，进一步包括测定至少一种在样 品中组成型表达的基因的表达水平。

9.权利要求1-5任一项的方法，其中特异性为至少约40％。

10.权利要求1-5任一项的方法，其中灵敏度为至少约90％。

11.权利要求1-5任一项的方法，其中将基因表达模式与指示复 发患者的表达模式进行比较。

12.权利要求11的方法，其中使用模式识别方法进行表达模式 比较。

13.权利要求12的方法，其中模式识别方法包括使用Cox比例 风险分析。