[发明专利]鉴定维生素D代谢改变的方法无效
申请号: | 200780003787.5 | 申请日: | 2007-01-31 |
公开(公告)号: | CN101448955A | 公开(公告)日: | 2009-06-03 |
发明(设计)人: | D·L·柴普;J·缪迪;L·J·科格奈特;C·S·约翰逊 | 申请(专利权)人: | 健康研究股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C07H21/02;C12P19/34;C07H21/04 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 | 代理人: | 张宜红 |
地址: | 美国*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴定 维生素 代谢 改变 方法 | ||
1.一种测定个体是否可能具有改变的钙三醇分解代谢的方法,其中,所述方法包括:
a)获得个体的生物学样品;和
b)测定是否存在
i)至少一种表2所列的单核苷酸多态性(SNP);
ii)异常剪接的CYP24 mRNA;
iii)钙三醇不敏感的剪接;或
iv)i)到iii)的组合;
其中测定i)、ii)或它们的组合表明,与不具有i)或ii)的个体相比,该个体可能具有降低的钙三醇分解代谢,其中存在iii)表明与不具有iii)的个体相比,该个体可能具有高的钙三醇分解代谢。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,先将钙三醇给予个体来诱导所述CYP24 mRNA的异常剪接,再获得该个体的生物学样品。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述异常剪接的CYP24 mRNA包含从CYP24基因内含子11和12之间的内含子转录的多核苷酸序列。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述至少一种SNP是表2所示的4号SNP。
5.如权利要求3所述的方法,其特征在于,通过RT-PCR扩增CYP24mRNA以获得CYP24 cDNA,相比于大小已知的标记来分析该cDNA的大小以鉴定异常剪接的CYP24 cDNA,从而确定异常剪接的CYP24 mRNA是否存在。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,利用具有如SEQ ID NO:3所示序列的第一引物和具有SEQ ID NO:4所示序列的第二引物进行所述RT-PCR,其中所述RT-PCR扩增包含CYP24基因外显子9和10之间内含子的核苷酸序列和/或CYP24基因外显子10和11之间内含子的核苷酸序列的cDNA。
7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,通过以下方式确定至少一种SNP的存在或不存在:通过PCR扩增CYP24基因中包含CYP24基因外显子9和CYP24基因外显子10之间的内含子序列的区域以获得PCR扩增产物,分析该PCR扩增产物的序列以确定所述至少一种SNP的存在或不存在。
8.如权利要求1所述的方法,其特征在于,通过以下方式确定至少一种SNP的存在或不存在:通过PCR扩增CYP24基因中包含CYP24基因外显子11和CYP24基因外显子12之间的内含子序列的区域以获得PCR扩增产物,分析该PCR扩增产物的序列以确定所述至少一种SNP的存在或不存在。
9.一种测定需要维生素D治疗的个体的钙三醇、钙三醇前体或维生素D类似化合物的给药剂量方案的方法,其中所述维生素D类似化合物产生的血钙反应低于钙三醇产生的血钙反应,所述方法包括:
a)获得个体的生物学样品;和
b)测定该生物学样品中是否存在
i)至少一种表2所列的SNP;
ii)异常剪接的CYP24 mRNA;或
iii)钙三醇不敏感的剪接;或
iv)i)到iii)的组合;
其中存在i)或ii)或它们的组合表明,与不具有i)或ii)的需要维生素D治疗的个体相比,该个体是较低剂量钙三醇、钙三醇前体或维生素D类似物的候选对象,并且其中存在iii)表明与不具有iii)的需要维生素D治疗的个体相比,该个体是较高剂量钙三醇或钙三醇前体的候选对象。
10.如权利要求9所述的方法,其特征在于,先将钙三醇、钙三醇前体或维生素D类似物给予个体来诱导所述CYP24 mRNA的异常剪接,再获得该个体的生物学样品。
11.如权利要求9所述的方法,其特征在于,所述钙三醇前体选自:维生素D和胆钙化甾醇。
12.如权利要求9所述的方法,其特征在于,所述维生素D类似化合物选自:1α,25-(OH)2-24-表-D2,1α,25-(OH)2-24a-高-D3,1α,25-(OH)2-24a-二高-D3,1α,25-(OH)2-19-降-D3和20-表-24-高-1α,25-(OH)2-D3。
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