[发明专利]膜蛋白分类在线预报方法无效
| 申请号： | 200710171805.2 | 申请日： | 2007-12-06 |
| 公开（公告）号： | CN101187960A | 公开（公告）日： | 2008-05-28 |
| 发明（设计）人： | 金雨欢;陆文聪;钮冰;刘亮;王丽 | 申请（专利权）人： | 上海大学 |
| 主分类号： | G06F19/00 | 分类号： | G06F19/00;G06F15/18 |
| 代理公司： | 上海上大专利事务所 | 代理人： | 何文欣 |
| 地址： | 200444*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 膜蛋白 分类 在线 预报 方法 | ||
1.一种膜蛋白分类在线预报方法，其特征在于利用机器学习方法Bagging，对一个膜蛋白数据库样本进行学习，输出学习模型；由预报器载入该学习模型，输入数据传输器将Web客户端提交的膜蛋白序列码转换为只包含“0”和“1”的数据，输出模蛋白分类预测结果，通过Servlet组件返回到Web客户端。
2.根据权利要求1所述的膜蛋白分类在线预报方法，其特征在于具体操作步骤为：
(1)构建膜蛋白分类模型；
(2)进行膜蛋白分类预报。
3.根据权利要求2所述的膜蛋白分类在线预报方法，其特征在于所述的步骤(1)中的构建模蛋白分类模型的步骤为：
①采集训练本集：采集自互联网上的蛋白质数据库，该数据库的数据都已明确膜蛋白分类类型；通过计算机程序，将蛋白序列码转换成为只包含“0”和“1”的数据作为自变量，目标变量是膜蛋白分类类型；
②Bagging方法学习：用Java编程语言实现Bagging算法；
③输出学习模型：上述的Bagging方法学习完成对样本数据的学习，得到膜蛋白分类的预报模型，将此模型对象进行序列化。
4.根据权利要求2所述的膜蛋白分类在线预报方法，其特征在于所述的步骤(2)中的进行膜蛋白分类预报的步骤如下：
①将膜蛋白分类预报模型输入预报组件；
②输入数据经数据转换器转换后输入预报组件；
③预报组件读取膜蛋白分类预报模型，载入转换后的输入数据，进行处理后得到膜蛋白分类信息的预报结果；
④预报组件输出预报结果至Servlet组件返回至Web客户端，完成一次膜蛋白分类预报工作。
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G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
