[发明专利]一种合成RNA单体的方法有效

专利信息
申请号: 200710039568.4 申请日: 2007-04-18
公开(公告)号: CN101289486A 公开(公告)日: 2008-10-22
发明(设计)人: 曹跃琼 申请(专利权)人: 上海吉凯基因化学技术有限公司
主分类号: C07H21/02 分类号: C07H21/02
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 201203上海*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 合成 rna 单体 方法
【说明书】:

发明公开了一种合成RNA单体的方法。该方法中所采用的RNA合成单体以 其独特的2’-保护基为出发点,RNA合成单体结构不同于以往的RNA合成单体。 其特点在于该保护基在酸性脱保护条件下稳定,在硷性脱保护条件下也很稳定。 在固相合成完成后,在把5’-DMT保护基脱掉而2’-保护基仍在链上的情况下可 以进行高压液相纯化,一级纯化后的产品可以在适当的条件下将2’-保护基完 全脱下来,进一步纯化后即可与另一条互补链退火成双链。由此合成及纯化获 得的RNA寡核苷酸纯度可达97%以上,纯化回收率可达55%以上。

技术领域

本发明涉及一种RNA单体的制备方法。

背景技术

RNA单体目前由Glen Research,Transgenomic,ChemGene等少数几个大公 司垄断生产,国内无任何RNA单体生产厂家;我们依靠自有技术生产的RNA单体 质量指标高于现有厂家生产产品;

发明内容

本发明的目的在于采用独特的2’-保护基为出发点,合成RNA单体。 本发明的上述目的是通过下述技术方案实现的:

A.制备2’-保护基1-(3-氯苯)-4-哌啶烯(CPP);

B.尿苷单体合成;

C.胞苷单体合成;

D.腺苷单体合成;

E.鸟苷单体合成;

所述的RNA单体合成方法,其特征在于:

采用独特的2’-保护基1-(3-氯苯)-4-哌啶烯(CPP)为出发点,合成RNA 单体。

附图说明

图1为CPP制备方法结构图:

图2为尿苷单体合成流程图:

图3为胞苷单体合成流程图:

图4为腺苷单体合成流程图:

图5为鸟苷单体合成流程图:

具体实施方式

2’-保护基CPP的制备方法:

3-氯丙酰氯与乙烯在刘易斯酸的作用下生产1,5-二氯戊酮,再与3-氯 苯胺缩合形成N-(3-氯苯)-哌啶酮,后者再与甲醇缩合生成二甲基-N-(3- 氯苯)-哌啶缩酮,最后再在减压加热条件下脱掉一分子甲醇生成所要的 1-(3-氯苯)-4-哌啶烯(CPP);

RNA合成单体的制备:

尿苷单体:3’,5’-氢氧基用Marcwicz保护基进行保护,然后在酸 性条件下引入2’-CPP保护基,随后脱去Marcwicz保护基,5’-氢氧 基用1,4-二甲氧基三苯甲烷氯(DMTrCl)进行保护,最后在3’-位用磷酸化 试剂进行亚磷酰胺化,制得尿苷单体。

胞苷单体、腺苷单体、鸟苷单体制备:将胞苷/腺苷/鸟苷的碱基先用苯 甲酰基保护,后继步骤与鸟苷相同。

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