[发明专利]家蝇抗菌肽基因及其筛选克隆方法无效
| 申请号: | 200710029081.8 | 申请日: | 2007-07-09 |
| 公开(公告)号: | CN101139593A | 公开(公告)日: | 2008-03-12 |
| 发明(设计)人: | 朱家勇;刘雷山;金小宝 | 申请(专利权)人: | 广东药学院 |
| 主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C07K14/435 |
| 代理公司: | 广州粤高专利代理有限公司 | 代理人: | 陈卫 |
| 地址: | 510006广东省广州*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 家蝇 抗菌 基因 及其 筛选 克隆 方法 | ||
1.一种家蝇抗菌肽基因,其特征在于序列表如SEQ ID NO:1,全长460bp,从57bp~356bp、起始密码子为ATG、终止密码子为TAA、含300bp的区域编码99个氨基酸。
2.权利要求1所述家蝇抗菌肽基因的筛选克隆方法,其特征在于包括以下步骤:
(1)采用基因芯片技术筛选出家蝇相关基因;
(2)设计简并引物,获取同源片断;
(3)行RT-PCR扩增出基因片段;
(4)以全长文库做模板,结合文库通用引物行特异性PCR扩增出该抗菌肽基因的全长序列。
3.根据权利要求2所述家蝇抗菌肽基因的筛选克隆方法,其特征在于步骤(1)包括以下步骤:
(1)设计探针,将探针点印在芯片上构建寡核苷酸探针微阵列,打印好的芯片经紫外交联处理后放暗盒中保存备用;
(2)芯片预杂交处理;
(3)提取和纯化家蝇脂肪体总RNA,逆转录成cDNA并标记上荧光标记物Cy3,与构建的寡核苷酸探针微阵列芯片杂交;
(4)经洗片、扫描处理后进行数据分析。
4.根据权利要求3所述家蝇抗菌肽基因的筛选克隆方法,其特征在于步骤(3)所述家蝇是经过诱导的家蝇三龄期幼虫。
5.根据权利要求4所述家蝇抗菌肽基因的筛选克隆方法,其特征在于所述诱导是取家蝇三龄期幼虫,用昆虫针蘸取金黄色葡萄球菌和大肠杆菌混合菌液,从腹部进行刺针,再放回饲养24小时后收集。
6.根据权利要求2所述家蝇抗菌肽基因的筛选克隆方法,其特征在于步骤(2)所述设计简并引物为:
上游简并引物A1:5′-GHGGHWSBCCHAARGATGG-3′19bp
下游简并引物A2:5′-RTTDCCRTADGGDCCDCC-3′18bp。
7.根据权利要求2所述家蝇抗菌肽基因的基于基因芯片筛选克隆方法,其特征在于步骤(3)所述行RT-PCR扩增出基因片段包括目的基因cDNA的3′端克隆和目的基因cDNA 5′端克隆。
8.根据权利要求7所述家蝇抗菌肽基因的基于基因芯片筛选克隆方法,其特征在于所述目的基因cDNA的3′端克隆引物为
上游引物B1:5′CAA TGT AAA TGC CGA TGT C 3′(19bp)
下游引物p2:5/ TAA TAC GAC TCA CTA TAG GGC 3/(21bp)。
9.根据权利要求7所述家蝇抗菌肽基因的基于基因芯片筛选克隆方法,其特征在于所述目的基因cDNA 5′端克隆引物为
上游引物P1:5/ CTC CGA GAT CTG GAC GAG C 3/ (19bp)
下游引物B2:5′TTA CAT TGC CTT AAA AAT CAC CT 3′(23bp)。
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