[发明专利]用于鉴定病原体的寡核苷酸微阵列

权利要求书

1.一种用于检测生物样品或检验样品中一种或更多种病原体的 目标核酸的方法，所述方法包括：

利用结合不止一种病原体的保守区的一对或更多对引物来扩增 样品中的目标核酸；

使扩增的目标核酸与寡核苷酸微阵列接触，所述微阵列包括含与 不同病原体互补的多核苷酸序列的两种或以上探针或两个或以上的 探针组；

检测目标核酸与探针的结合情况，其中与特定病原体探针结合则 意味着在样品中存在该病原体。

2.权利要求1的方法，其中所述病原体选自：链球菌、沙门氏菌、 葡萄球菌、支原体、单核细胞增生李斯特氏菌(L.monocytogenes)、脑 膜炎奈瑟氏菌(N.meningtides)、大肠杆菌、流感嗜血杆菌(H. influenzae)、布氏疏螺旋体(B.burgdorferi)、钩端螺旋体、变形菌、厌 氧菌、结核分支杆菌(M.tuberculosis)、肠球菌、脊髓灰质炎病毒1、 肠道病毒71、肠道病毒70、艾柯病毒2、艾柯病毒4、艾柯病毒6、 艾柯病毒9、艾柯病毒11、艾柯病毒12、艾柯病毒26、柯萨奇病毒 A13、柯萨奇病毒A15、柯萨奇病毒A18、柯萨奇病毒A20、柯萨奇 病毒A21、柯萨奇病毒B3-A、柯萨奇病毒B3-C、HSV-1和HSV-2。

3.权利要求2的方法，其中所述探针选自SEQ ID NO：13-52。

4.权利要求3的方法，其中所述目标核酸是大肠杆菌和沙门氏 菌，而所述探针选自SEQ ID NO：14-17和22-26。

5.权利要求1的方法，其中所述扩增步骤包括利用选自SEQ ID NO：1-12的一对或更多对引物进行聚合酶链式反应(PCR)。

6.权利要求5的方法，其中所述引物选自下述引物对：SEQ ID NO：1和2；SEQ ID NO：1和4；SEQ ID NO：1和6；SEQ ID NO：3 和2；SEQ ID NO：3和4；SEQ ID NO：3和6；SEQ ID NO：5和2； SEQ ID NO：5和4；SEQ ID NO：5和6；SEQ ID NO：5和6；SEQ ID NO： 7和8；SEQ ID NO：9和10；以及SEQ ID NO：11和12。

7.权利要求6的方法，其中所述引物对是SEQ ID NO：1-2和SEQ ID NO：7-8。

8.权利要求5的方法，其中所述探针包括选自SEQ ID NO：13-52 的多核苷酸序列。

9.权利要求8的方法，其中微阵列包括来自至少一种病原体的2 种或以上探针。

10.权利要求1的方法，其中所述生物样品选自组织、细胞、血 液、血清、脑脊液、尿、细胞裂解物、血浆、粪便、唾液、血细胞、 细针活检样品、腹膜液和胸膜液，或来自以上样品的细胞。

11.权利要求1的方法，其中所述微阵列包括与普通症状有关的 病原体的探针。

12.权利要求1的方法，其中所述微阵列包括与普通感染途径有 关的病原体的探针。

13.一种辨别样品中的大肠杆菌和沙门氏菌的方法，所述方法包 括：

利用结合大肠杆菌和沙门氏菌中的保守区的一对或更多对引物 扩增样品中的核酸；

使扩增的目标核酸与寡核苷酸微阵列接触，所述微阵列包括含与 大肠杆菌和沙门氏菌中的可变区互补的多核苷酸序列的两种或以上 探针；

检测核酸与作为指示大肠杆菌和沙门氏菌在样品中存在的探针 的结合情况。

14.权利要求13的方法，其中所述微阵列包括：大肠杆菌的两个 或以上探针组以及沙门氏菌的两个或以上探针组，其中每个探针组包 括与所述病原体互补的两种或以上不同的探针。

15.权利要求13的方法，其中所述引物对选自SEQ ID NO：1-6。