[发明专利]质粒DNA的纯化方法有效

专利信息
申请号: 200680003564.4 申请日: 2006-01-27
公开(公告)号: CN101310022A 公开(公告)日: 2008-11-19
发明(设计)人: D·B·博伊德;A·J·克里斯托佩特;R·J·兰德;J·C·墨菲;M·A·温特斯 申请(专利权)人: 默克公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 中国专利代理(香港)有限公司 代理人: 刘健;黄可峻
地址: 美国新*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 质粒 dna 纯化 方法
【权利要求书】:

1.从大规模微生物发酵的细胞溶胞产物中纯化超螺旋质粒DNA 的方法,所述方法包括:

(a)裂解含超螺旋质粒DNA的微生物宿主细胞,形成宿主细胞 溶胞产物;

(b)通过用聚乙二醇(PEG)絮凝宿主细胞碎片来澄清所述宿主 细胞溶胞产物,其中所述PEG的浓度是使絮凝步骤期间质粒DNA沉 淀的可能性最小的浓度;和

(c)除去絮凝的宿主细胞碎片,产生含有所述超螺旋质粒DNA 的澄清的溶胞产物。

2.权利要求1的方法,其中将步骤(a)的宿主细胞在含溶菌酶的 标准STET缓冲液中裂解。

3.权利要求2的方法,其中STET缓冲液含PEG。

4.权利要求1的方法,其中在溶胞作用后向宿主细胞溶胞产物中 加入PEG。

5.权利要求4的方法,其中PEG絮凝剂的分子量在1450Da到 15,000Da之间。

6.权利要求4的方法,其中在加入PEG前将宿主细胞溶胞产物的 pH调至碱性,随后再中和。

7.权利要求6的方法,其中将pH调至碱性和随后的中和反应包 括将宿主细胞溶胞产物的pH升高到pH 12-pH 13的碱性值,随后降 低所述细胞溶胞产物的pH到pH 7-pH 9的值。

8.权利要求4的方法,其中在加入PEG后将宿主细胞溶胞产物的 pH调至碱性,随后再中和。

9.权利要求8的方法,其中将pH调至碱性和随后的中和反应包 括将含PEG的宿主细胞溶胞产物的pH升高到pH 12-pH 13的碱性 值,随后降低所述溶胞产物的pH到pH 7-pH 9的值。

10.从大规模微生物发酵的细胞溶胞产物中纯化超螺旋质粒DNA 的方法,所述方法包括:

(a)在生理裂解缓冲液中裂解含超螺旋质粒DNA的微生物宿主 细胞,形成宿主细胞溶胞产物;

(b)通过将所述溶胞产物的pH升高到pH 12-pH 13,使步骤(a) 中的宿主细胞溶胞产物的pH调至碱性;

(c)中和步骤(b)中调至碱性的细胞溶胞产物至pH 7-pH 9;

(d)通过用PEG絮凝宿主细胞碎片,来澄清步骤(c)的细胞溶 胞产物,其中所述PEG的浓度是使絮凝步骤期间质粒DNA沉淀的可 能性最小的浓度;和,

(e)除去步骤(d)的所述絮凝的宿主细胞碎片,获得含可溶超 螺旋质粒DNA的上清液。

11.权利要求10的方法,其中步骤(a)的生理裂解缓冲液是标准 STET缓冲液。

12.权利要求10的方法,其中在步骤(d)和(e)之间加入去垢 剂诱导的沉淀步骤来沉淀碎片和非超螺旋质粒,进一步澄清细胞溶胞 产物。

13.权利要求12的方法,其中去垢剂是溴化十六烷基三甲基铵 (CTAB)。

14.从大规模微生物发酵的细胞溶胞产物中纯化超螺旋质粒DNA 的方法,所述方法包括:

(a)在生理裂解缓冲液中裂解含超螺旋质粒DNA的微生物宿主 细胞,形成宿主细胞溶胞产物;

(b)通过用PEG絮凝剂絮凝宿主细胞碎片,来澄清所述宿主细 胞溶胞产物,其中所述PEG絮凝剂的浓度是使絮凝步骤期间质粒DNA 沉淀的可能性最小的浓度;

(c)用PEG沉淀所述超螺旋质粒DNA;和

(b)通过切向流过滤模式下的微量过滤来浓缩所述沉淀的超螺旋 质粒DNA。

15.权利要求14的方法,其中将步骤(a)的所述宿主细胞在标准 STET缓冲液中裂解。

16.权利要求15的方法,其中在加入PEG絮凝剂前将宿主细胞溶 胞产物的pH调至碱性,随后再中和。

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