[发明专利]质粒DNA的纯化方法有效
申请号: | 200680003564.4 | 申请日: | 2006-01-27 |
公开(公告)号: | CN101310022A | 公开(公告)日: | 2008-11-19 |
发明(设计)人: | D·B·博伊德;A·J·克里斯托佩特;R·J·兰德;J·C·墨菲;M·A·温特斯 | 申请(专利权)人: | 默克公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 | 代理人: | 刘健;黄可峻 |
地址: | 美国新*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 质粒 dna 纯化 方法 | ||
1.从大规模微生物发酵的细胞溶胞产物中纯化超螺旋质粒DNA 的方法,所述方法包括:
(a)裂解含超螺旋质粒DNA的微生物宿主细胞,形成宿主细胞 溶胞产物;
(b)通过用聚乙二醇(PEG)絮凝宿主细胞碎片来澄清所述宿主 细胞溶胞产物,其中所述PEG的浓度是使絮凝步骤期间质粒DNA沉 淀的可能性最小的浓度;和
(c)除去絮凝的宿主细胞碎片,产生含有所述超螺旋质粒DNA 的澄清的溶胞产物。
2.权利要求1的方法,其中将步骤(a)的宿主细胞在含溶菌酶的 标准STET缓冲液中裂解。
3.权利要求2的方法,其中STET缓冲液含PEG。
4.权利要求1的方法,其中在溶胞作用后向宿主细胞溶胞产物中 加入PEG。
5.权利要求4的方法,其中PEG絮凝剂的分子量在1450Da到 15,000Da之间。
6.权利要求4的方法,其中在加入PEG前将宿主细胞溶胞产物的 pH调至碱性,随后再中和。
7.权利要求6的方法,其中将pH调至碱性和随后的中和反应包 括将宿主细胞溶胞产物的pH升高到pH 12-pH 13的碱性值,随后降 低所述细胞溶胞产物的pH到pH 7-pH 9的值。
8.权利要求4的方法,其中在加入PEG后将宿主细胞溶胞产物的 pH调至碱性,随后再中和。
9.权利要求8的方法,其中将pH调至碱性和随后的中和反应包 括将含PEG的宿主细胞溶胞产物的pH升高到pH 12-pH 13的碱性 值,随后降低所述溶胞产物的pH到pH 7-pH 9的值。
10.从大规模微生物发酵的细胞溶胞产物中纯化超螺旋质粒DNA 的方法,所述方法包括:
(a)在生理裂解缓冲液中裂解含超螺旋质粒DNA的微生物宿主 细胞,形成宿主细胞溶胞产物;
(b)通过将所述溶胞产物的pH升高到pH 12-pH 13,使步骤(a) 中的宿主细胞溶胞产物的pH调至碱性;
(c)中和步骤(b)中调至碱性的细胞溶胞产物至pH 7-pH 9;
(d)通过用PEG絮凝宿主细胞碎片,来澄清步骤(c)的细胞溶 胞产物,其中所述PEG的浓度是使絮凝步骤期间质粒DNA沉淀的可 能性最小的浓度;和,
(e)除去步骤(d)的所述絮凝的宿主细胞碎片,获得含可溶超 螺旋质粒DNA的上清液。
11.权利要求10的方法,其中步骤(a)的生理裂解缓冲液是标准 STET缓冲液。
12.权利要求10的方法,其中在步骤(d)和(e)之间加入去垢 剂诱导的沉淀步骤来沉淀碎片和非超螺旋质粒,进一步澄清细胞溶胞 产物。
13.权利要求12的方法,其中去垢剂是溴化十六烷基三甲基铵 (CTAB)。
14.从大规模微生物发酵的细胞溶胞产物中纯化超螺旋质粒DNA 的方法,所述方法包括:
(a)在生理裂解缓冲液中裂解含超螺旋质粒DNA的微生物宿主 细胞,形成宿主细胞溶胞产物;
(b)通过用PEG絮凝剂絮凝宿主细胞碎片,来澄清所述宿主细 胞溶胞产物,其中所述PEG絮凝剂的浓度是使絮凝步骤期间质粒DNA 沉淀的可能性最小的浓度;
(c)用PEG沉淀所述超螺旋质粒DNA;和
(b)通过切向流过滤模式下的微量过滤来浓缩所述沉淀的超螺旋 质粒DNA。
15.权利要求14的方法,其中将步骤(a)的所述宿主细胞在标准 STET缓冲液中裂解。
16.权利要求15的方法,其中在加入PEG絮凝剂前将宿主细胞溶 胞产物的pH调至碱性,随后再中和。
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