[发明专利]用滚环扩增法扩增多核苷酸无效
| 申请号: | 200480027696.1 | 申请日: | 2004-09-27 |
| 公开(公告)号: | CN101415838A | 公开(公告)日: | 2009-04-22 |
| 发明(设计)人: | 王友祥;宗亚平 | 申请(专利权)人: | 首科安普有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/10 |
| 代理公司: | 北京银龙知识产权代理有限公司 | 代理人: | 钟 晶 |
| 地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 美国;US |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用滚环 扩增 多核苷酸 | ||
1.一种扩增和检测靶核酸分子的方法,该方法包括:
a)在靶核酸分子上连接第一接头核酸分子或第二接头核酸分子或第 一接头和第二接头核酸分子的组合;
b)环化靶核酸分子;
c)扩增该环化的核酸分子产生重复的核酸序列。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述环化用选自以下组的方法进 行:平端连接、退火相互补的两端然后连接、互补区域之间的连接、自身引 发连接、化学反应和光反应。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,所述靶核酸分子选自:mRNA, rRNA,RNAi,异核RNA,基因组DNA和cDNA。
4.根据权利要求1所述的方法,其中,所述第一接头核酸分子用选自以 下组的方法进行连接:连接、杂交连接、杂交然后聚合酶延伸、酶反应、化 学反应和光反应。
5.根据权利要求1所述的方法,其中,所述第一接头核酸分子还含有选 自以下组的序列:检测序列、位点特异性重组序列、同源重组序列、限制性 内切酶序列、启动子序列、转录终止序列、核糖体结合序列、核酶序列、复 制起始序列、基因序列和发夹环序列。
6.根据权利要求1所述的方法,还包括在环化前连接第二接头核酸分子。
7.根据权利要求1所述的方法,其中,所述第二接头核酸分子用选自以 下组的方法进行连接:连接、杂交连接、杂交然后聚合酶延伸、酶反应、化 学反应和光反应。
8.根据权利要求6所述的方法,其中,所述第二接头核酸分子还含有选 自以下组的序列:检测序列、位点特异性重组序列、同源重组序列、限制性 内切酶序列、启动子序列、转录终止序列、核糖体结合序列、核酶序列、复 制起始序列、基因序列和发夹环序列。
9.根据权利要求1所述的方法,其中,所述第一接头或第二接头核酸分 子通过核酸的随机杂交和短暂延伸而连接。
10.根据权利要求1所述的方法,其中,所述扩增包括加入至少一种引 物。
11.根据权利要求1所述的方法,其中,所述扩增是在不加入引物的情 况下进行的。
12.根据权利要求10所述的方法,其中,所述引物在其3’端还包含随 机序列。
13.根据权利要求12所述的方法,其中,所述引物还包含启动子序列。
14.根据权利要求10所述的方法,其中,所述引物是RNA:DNA嵌合 体。
15.根据权利要求14所述的方法,其中,所述引物还包含启动子序列。
16.根据权利要求1所述的方法,其中,所述环化的靶核酸分子包含蛋 白质表达序列。
17.一种检测靶核酸分子的方法,该方法包括:
a)在样品中加入环形核酸分子,其中所述环形核酸分子包含能与该靶 核酸分子至少一部分杂交的第一核酸序列;
b)使环形核酸分子与靶核酸分子的该部分杂交;和
c)通过与所述靶核酸分子中至少一个游离3’端聚合合成至少一种新 的核酸,其至少与环形核酸的第二部分相互补,其中,所述至少一个 游离3’端产生在靶核酸分子上能与第一核酸序列杂交的部分。
18.根据权利要求17所述的方法,其中,所述靶核酸分子选自:mRNA、 rRNA、RNAi、异核RNA、基因组DNA和cDNA。
19.根据权利要求17所述的方法,其中,所述游离3’端在引物与靶核 酸杂交之前产生。
20.根据权利要求17所述的方法,其中,所述游离3’端在引物与靶核 酸杂交之后产生。
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