[发明专利]一种构建水平基因转移网络的方法在审

专利信息
申请号: 202310339757.2 申请日: 2023-03-24
公开(公告)号: CN116364169A 公开(公告)日: 2023-06-30
发明(设计)人: 赵梓丞;郑艳婷;高鹏 申请(专利权)人: 深圳百人科技有限公司
主分类号: G16B5/00 分类号: G16B5/00;G16B40/20;G16B30/00
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 518118 广东省深圳市坪山区坑梓街*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开了基因转移技术领域的一种构建水平基因转移网络的方法,包括以下步骤:S1:基于检测到的HGT事件构建初始物种HGT网络;S2:根据边的权重,对边进行过滤;S3:合并初始物种HGT网络的节点;HGT网络可通过一定的方法消除测序量对HGT网络的影响,使结果更加准确:测序量会影响HGT网络,但HGT网络构建之后,可通过在每个样本中只保留若干条最可靠边的手段来消除测序量的影响,其中边的可靠性是通过在两个分类群之间发生HGT中支持reads的总数来量化的,在实验中若对样本使用本方法,可以在每个样本中生成不同分类级别的HGT网络,来进行不同水平的分析,并且HGT网络可以反映微生物之间的基因交流和动态变化,可以提取更多生物学特征和信息。
搜索关键词: 一种 构建 水平 基因 转移 网络 方法
【主权项】:
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