[发明专利]从全转录基因组数据中挖掘微生物数据的方法在审

专利信息
申请号: 202310162262.7 申请日: 2023-02-24
公开(公告)号: CN116110497A 公开(公告)日: 2023-05-12
发明(设计)人: 张磊;靳传娣;生大双;岳凯乐;薛鑫鑫;梁益嘉;岳敏;李平福 申请(专利权)人: 张磊
主分类号: G16B20/30 分类号: G16B20/30
代理公司: 济南日新专利代理事务所(普通合伙) 37224 代理人: 杨亚男
地址: 250003 山东省济南*** 国省代码: 山东;37
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摘要: 发明涉及微生物组学技术领域,具体涉及一种从全转录基因组数据中挖掘微生物数据的方法。所述方法包括以下步骤:步骤1.提取原始测序数据中的非人序列并对其进行质量控制;步骤2.微生物比对及微生物序列过滤:使用kraken2构建标准微生物参考数据库,使用kraken2将步骤1提取的序列与参考数据库进行比对,获得序列的注释信息;基于序列的注释信息将未比对至微生物的序列进行过滤去除,进一步获取微生物序列和微生物物种丰度;步骤3.微生物基因和功能分析。本发明提供了一种更为标准、可靠、完整的从全转录基因组数据中挖掘微生物数据的方法。
搜索关键词: 转录 基因组 数据 挖掘 微生物 方法
【主权项】:
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