[发明专利]热点残基和靶点蛋白复合物结构的生成方法及装置在审
| 申请号： | 202210616239.6 | 申请日： | 2022-03-03 |
| 公开（公告）号： | CN114927160A | 公开（公告）日： | 2022-08-19 |
| 发明（设计）人： | 王天元;吴炜坤 | 申请（专利权）人： | 北京晶泰科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B15/00 | 分类号： | G16B15/00;G16B35/00 |
| 代理公司： | 北京汇鑫君达知识产权代理有限公司 11769 | 代理人： | 刘湘菲 |
| 地址： | 100083 北京市海淀区中*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本申请涉及一种热点残基和靶点蛋白复合物结构的生成方法及装置。该方法包括：将丙氨酸的原子坐标调整至靶点蛋白的特定表位区域后，在丙氨酸的两端分别延伸一个甘氨酸，形成初始三肽结构；将初始三肽结构中的丙氨酸分别突变为天然氨基酸或D型构象的天然氨基酸，获得对应的突变三肽结构；根据第一预设打分函数对突变三肽结构的骨架二面角随机赋值，获得对应的打分值并筛选获得候选三肽构象；候选三肽构象在靶点蛋白的特定表位区域中的局部区域进行分子对接，获得候选三肽与靶点蛋白的结合构象，并筛选获得结合自由能最低的优选三肽与靶点蛋白的结合构象。本申请的方案，可产生更多具有高可成环性的新热点残基或以优选三肽作为热点基序。 | ||
| 搜索关键词： | 热点 残基 蛋白 复合物 结构 生成 方法 装置 | ||
【主权项】：
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