[发明专利]跨语言平台的空间转录组数据转换方法及系统在审

专利信息
申请号: 202210550264.9 申请日: 2022-05-20
公开(公告)号: CN115206439A 公开(公告)日: 2022-10-18
发明(设计)人: 刘健;阮志涵;陈娇 申请(专利权)人: 南开大学
主分类号: G16B50/30 分类号: G16B50/30;G16B40/30
代理公司: 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 代理人: 黄海丽
地址: 300071 天津*** 国省代码: 天津;12
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摘要: 发明公开了跨语言平台的空间转录组数据转换方法及系统,对第一语言平台的空间转录组数据、单细胞转录组参考数据或空间转录组分析工具产生的中间结果,采用映射文件进行读取和存储;在第二语言平台上,读取存储的结果,继续运行;其中,所述采用映射文件进行读取和存储;具体包括:初始化映射文件;当第一语言平台为R语言平台;则在R语言平台上,实现映射文件与R语言中数据结构的相互转换操作;当第一语言平台为Python语言平台;则在Python平台上,实现映射文件与Python中数据结构的相互转换操作。减少存储空间的消耗,和提供兼容现有数据结构的读写策略,让工作流的构建更加简单,从而发挥不同平台上分析工具的优势。
搜索关键词: 语言 平台 空间 转录 数据 转换 方法 系统
【主权项】:
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