[发明专利]基因组性染色体非同源区域的鉴定方法和装置有效
| 申请号： | 202110746653.4 | 申请日： | 2021-07-02 |
| 公开（公告）号： | CN113205857B | 公开（公告）日： | 2021-09-28 |
| 发明（设计）人： | 周勋;赵勇;陶琳娜;苏亚南;王龙 | 申请（专利权）人： | 天津诺禾致源生物信息科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00 |
| 代理公司： | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人： | 路秀丽 |
| 地址： | 301700 天津市*** | 国省代码： | 天津;12 |
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| 摘要： | 本申请提供了一种基因组性染色体非同源区域的鉴定方法和装置。该鉴定方法包括获取XY型或ZW型个体以及XX型或ZZ型个体的二代测序数据，各个体的测序深度为第一测序深度；获取通过三代测序数据组装得到的XY型或ZW型个体的组装基因组；分别计算XY型或ZW型个体以及XX型或ZZ型个体的二代测序数据与组装基因组的比对结果中每个contig或scaffold测序深度，分别记为第二测序深度和第三测序深度；第二测序深度为第一测序深度的1/2~2/3，且第三测序深度小于第一测序深度的1/10的contig或scaffold是性染色体非同源区域。利用两种性别个体的reads深度共同鉴定的非同源区域更准确。 | ||
| 搜索关键词： | 基因组 染色体 同源 区域 鉴定 方法 装置 | ||
【主权项】：
暂无信息
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