[发明专利]细菌全基因组测序数据的自动化分析方法及系统在审
申请号: | 202110271336.1 | 申请日: | 2021-03-12 |
公开(公告)号: | CN112863603A | 公开(公告)日: | 2021-05-28 |
发明(设计)人: | 刘健;孙嘉良;陈娇 | 申请(专利权)人: | 南开大学 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 闫圣娟 |
地址: | 300071 天津*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | 本公开提供了一种细菌全基因组测序数据的自动化分析方法,包括:获取细菌基因组测序数据,判断测序数据类型;根据测序数据的类型分别进行相应预处理;根据用户选择的分析类型及预设的工具软件和软件参数,对预处理后的测序数据进行重测序分析和从头测序分析;实现细菌全基因组的鉴定和注释。所述方案提供了一种用户友好的自动化分析方法,对于没有专业生物信息学知识的研究人员和临床医生,自动化了生物信息学分析步骤,包括测序质量控制、重测序和从头组装、相似细菌参考基因组鉴定、细菌基因组注释,同时,能够针对不同平台产生的短读长和长读长测序数据进行定制的生物信息学分析,获得准确的分析结果。 | ||
搜索关键词: | 细菌 基因组 序数 自动化 分析 方法 系统 | ||
【主权项】:
暂无信息
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