[发明专利]基于全基因组InDel标记鉴定金兰柚品种的方法在审
| 申请号: | 202010257167.1 | 申请日: | 2020-04-03 |
| 公开(公告)号: | CN111286556A | 公开(公告)日: | 2020-06-16 |
| 发明(设计)人: | 汤雨晴;王楠;朱方红 | 申请(专利权)人: | 江西省农业科学院园艺研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司: | 苏州中合知识产权代理事务所(普通合伙) 32266 | 代理人: | 刘召民 |
| 地址: | 330200 江西*** | 国省代码: | 江西;36 |
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| 摘要: | 本发明公开了一种基于全基因组InDel标记鉴定金兰柚品种的方法,所述鉴定方法包括以下步骤:S1、利用二代测序技术对金兰柚样品进行基因组重测序,以晚白柚为参考基因组,将测序得到的片段与参考基因组序列进行比对;S2、利用设定的参数进行InDel标记筛选;S3、挑选200个InDel位点设计引物并进行PCR检测,最后在全基因组范围内共筛选出81对杂合位点作为用于鉴定的标记;S4、利用S3筛选出的标记进行染色体定位和基因序列注释,实现对金兰柚品种的鉴定。本发明开发一组金兰柚全基因组InDel分子标记,通过检测一对或多对与金兰柚相关的InDel标记,可以有效鉴定是否为金兰柚品种,为金兰柚品种保护和快速鉴定提供了有效方法。 | ||
| 搜索关键词: | 基于 基因组 indel 标记 鉴定 金兰 品种 方法 | ||
【主权项】:
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