[发明专利]一种宏基因组数据挖掘方法有效
申请号: | 201911343764.X | 申请日: | 2019-12-24 |
公开(公告)号: | CN111192630B | 公开(公告)日: | 2023-10-13 |
发明(设计)人: | 张俊亚;魏源送 | 申请(专利权)人: | 中国科学院生态环境研究中心 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00;G16B50/00 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 冀志华 |
地址: | 100085*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及一种宏基因组数据挖掘方法,包括以下步骤:1)从KEGG数据库中获取目标代谢途径的全部基因信息,并建立特异性数据库;2)建立目标代谢途径的特异性数据库的映像文件;3)基于获得的目标代谢途径的特异型数据库,对宏基因组测序获得的clean reads进行数据库快速比对,得到各样品的比对结果;4)对各样品的比对结果进行排序、统计和整合;5)对各样品的注释结果进行均一化处理,根据均一化结果进行不同样品间的定量分析。本发明能够快速建立指定代谢途径的特异性数据库用于后续分析,并能够对数据进行均一化和后处理,进而定量化比较不同样品中代谢途径相关基因差异,因而,可以广泛应用于宏基因组数据挖掘领域。 | ||
搜索关键词: | 一种 宏基 数据 挖掘 方法 | ||
【主权项】:
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