[发明专利]一种面向SSD的基因对比方法及系统有效
| 申请号： | 201910354585.X | 申请日： | 2019-04-29 |
| 公开（公告）号： | CN110085284B | 公开（公告）日： | 2021-02-26 |
| 发明（设计）人： | 王毅;林观泉;陈炜轩;黄江帆;毛睿;廖好;周池 | 申请（专利权）人： | 深圳大学 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G06F3/06 |
| 代理公司： | 北京三聚阳光知识产权代理有限公司 11250 | 代理人： | 梁岩 |
| 地址： | 518060 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种面向SSD的基因对比方法及基于此方法的比对系统。本发明所述的方法主要包括获取第一DNA片段和第二DNA片段，在SSD中对两个DNA片段进行对齐处理；从SSD中读取所述两个DNA片段的数据，根据所述两个DNA片段的数据及预设的精度参数确定对比参数；基于对比参数，对所述两个DNA片段进行递进式对比，得到对比结果。本发明结合SSD，一方面减少了数据读写次数；另一方面通过对齐，递进式对比等手段将数据作了一个粗略的筛选，大大减少了需要编辑距离计算的数据的比例，提升了效率，缩短了计算时间。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 面向 ssd 基因 对比 方法 系统 | ||
【主权项】：
1.一种面向SSD的基因对比方法，其特征在于，所述方法包括：获取第一DNA片段和第二DNA片段，在SSD中对两个DNA片段进行对齐处理；从SSD中读取所述两个DNA片段的数据，根据所述两个DNA片段的数据及预设的精度参数确定对比参数；基于对比参数，对所述两个DNA片段进行递进式对比，得到对比结果。
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