[发明专利]一种用于肺炎支原体的多位点SNP基因分型方法有效
| 申请号: | 201910314051.4 | 申请日: | 2019-04-18 |
| 公开(公告)号: | CN109957623B | 公开(公告)日: | 2022-05-17 |
| 发明(设计)人: | 赵飞;张建中;肖迪;龚杰;刘立雍;何利华;孟凡亮 | 申请(专利权)人: | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君;陈征 |
| 地址: | 10220*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | 本发明公开了一种用于肺炎支原体的多位点SNP基因分型方法,属于肺炎支原体基因分型技术领域。本发明通过对肺炎支原体全基因测序株序列比对分析,筛选出遗传稳定、种间区分度高的6个SNP位点,并将其组合使用,可将肺炎支原体分成63个基因型,每个基因型都是固定的,该方法分型准确,重复性好,操作简单,可同时进行大批量样品检测,其分性能力比现有的MLVA和SNP分型技术区分度强,既包含了传统的两种基因型肺炎支原体分型理念,又具备了高分辨率能力,为一种优秀的肺炎支原体基因分型技术。 | ||
| 搜索关键词: | 一种 用于 肺炎 支原体 多位点 snp 基因 方法 | ||
【主权项】:
1.与肺炎支原体基因分型相关的SNP位点组合,其特征在于,含有6个SNP位点,其中,SNP位点1位于MPN114基因中,nt150211,C/T;SNP位点2位于MPN126基因中,nt164082,C/T;SNP位点3位于MPN213基因中,nt262175,G/T;SNP位点4位于非编码区,MPN262基因上游,nt314572,C/T;SNP位点5位于MPN280基因中,nt333000,G/T;SNP位点6位于MPN372基因中,nt445452,G/T。
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