[发明专利]一种抗羊F17大肠杆菌感染的基因筛选方法在审

专利信息
申请号: 201910119231.7 申请日: 2019-02-18
公开(公告)号: CN109797198A 公开(公告)日: 2019-05-24
发明(设计)人: 孙伟;鲍建军;金澄艳;吕晓阳;高雯;于嘉瑞;陈炜昊 申请(专利权)人: 扬州大学
主分类号: C12Q1/6809 分类号: C12Q1/6809;C12Q1/6888;G16B30/00;G16B20/00
代理公司: 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 代理人: 薛海霞;董建林
地址: 225009 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种抗羊F17大肠杆菌感染的基因筛选方法,包括以下步骤:F17大肠杆菌感染发病羔羊和抗病羔羊的筛选及脾脏和肠道内容物样品的采集;F17大肠杆菌感染发病羔羊和抗病羔羊脾脏样品的高通量测序;F17大肠杆菌感染发病羔羊和抗病羔羊脾脏转录组学对比分析;以及抗F17大肠杆菌感染的基因(circRNA)的筛选及鉴定。本发明提出的抗羊F17大肠杆菌感染的基因的筛选方法,有针对性地从抗病羔羊脾脏中筛选具有抗F17大肠杆菌感染的基因(circRNA),准确性高、针对性强、节省时间。
搜索关键词: 大肠杆菌感染 羔羊 脾脏 抗病 筛选 基因筛选 基因 肠道内容物 高通量测序 对比分析 转录组 采集
【主权项】:
1.一种抗羊大肠杆菌感染的基因筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤S1、挑选F17大肠杆菌感染的发病羔羊和抗病羔羊,对应采集发病羔羊和抗病羔羊的脾脏和肠道内容物的样品;统计羔羊腹泻率,观察肠道组织形态结构,计算肠道细菌数量;步骤S2、提取发病羔羊和抗病羔羊的脾脏样品中基因组,进行高通量测序;步骤S3、对高通量测序的测序数据进行转录组学对比分析;步骤S4、根据转录组学对比分析的结果,比较发病羔羊和抗病羔羊脾脏中的差异基因,根据分析结果和基因的功能确定筛选基因,即筛选出抗羊F17大肠杆菌感染的基因。
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