[发明专利]抑制AGXT基因表达引起草酸性结石的分子机制及预警方法在审

专利信息
申请号: 201910045190.1 申请日: 2019-01-17
公开(公告)号: CN109750096A 公开(公告)日: 2019-05-14
发明(设计)人: 杜敦峰;陈知水;赵圆圆;杨杨 申请(专利权)人: 华中科技大学同济医学院附属同济医院
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;G01N33/573;C12N15/85
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地址: 430000 湖*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明属于基因工程技术领域,公开了一种抑制AGXT基因表达引起草酸性结石的分子机制及预警方法,进行生物信息学预测、分析miR‑4660/miR‑6797对基因AGXT 3’UTR的影响,确定靶标位点、利用细胞学水平分析miR‑4660对基因AGXT的表达、miRNAs及基因表达水平的检测:免疫组化检测、RT‑PCR实验检测。本发明从草酸代谢最重要基因AGXT的转录后调控机制入手,首次发现非编码小RNA(microRNA)hsa‑miR‑4660可以通过直接结合AGXT‑3’UTR区域抑制基因的转录和翻译,最终增加草酸结石的发生率。
搜索关键词: 草酸 转录 分子机制 基因表达 结石 基因 预警 生物信息学预测 基因表达水平 基因工程技术 免疫组化检测 草酸代谢 草酸结石 调控机制 区域抑制 实验检测 水平分析 直接结合 重要基因 发生率 非编码 细胞学 小RNA 靶标 位点 翻译 检测 分析 发现
【主权项】:
1.一种MiR‑4660抑制AGXT基因表达引起草酸性结石的分子机制及早期预警方法,其特征在于,所述MiR‑4660抑制AGXT基因表达引起草酸性结石的分子机制及早期预警方法包括:第一步,生物信息学预测:利用DIANA‑mT、miRanda、miRDB、miRWalk、RNAhybrid、PICRAR4、PICTAR5、PITA、RNA22、TargetScan的miRNAs与靶标基因结合位点预测软件对AGXT‑3’UTR的miRNAs靶标序列进行预测,并通过IBIVU server、UCSC检测结合位点保守性,分析miR‑4660和miR‑6797的结合AGXT 3‑’UTR特性;第二步,分析miR‑4660/miR‑697对基因AGXT 3’UTR的影响,确定靶标位点:将AGXT‑3’UTR亚克隆至pMIR‑Report荧光素酶报告基因下游,表达融合AGXT‑3’UTR的重组荧光素酶;将报告载体分别与hsa‑miR‑4660/hsa‑miR‑6797 mimics以及随机miRNA序列共同转染Hela细胞,培养后,分析融合重组荧光素酶报告载体荧光值变化;第三步,利用细胞学水平分析miR‑4660对基因AGXT的表达:进行RT‑PCR分析、Western blot分析;第四步,miRNAs及基因表达水平的检测:进行免疫组化检测、RT‑PCR实验检测。
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