[发明专利]抑制AGXT基因表达引起草酸性结石的分子机制及预警方法在审
申请号: | 201910045190.1 | 申请日: | 2019-01-17 |
公开(公告)号: | CN109750096A | 公开(公告)日: | 2019-05-14 |
发明(设计)人: | 杜敦峰;陈知水;赵圆圆;杨杨 | 申请(专利权)人: | 华中科技大学同济医学院附属同济医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;G01N33/573;C12N15/85 |
代理公司: | 北京金智普华知识产权代理有限公司 11401 | 代理人: | 杨采良 |
地址: | 430000 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 草酸 转录 分子机制 基因表达 结石 基因 预警 生物信息学预测 基因表达水平 基因工程技术 免疫组化检测 草酸代谢 草酸结石 调控机制 区域抑制 实验检测 水平分析 直接结合 重要基因 发生率 非编码 细胞学 小RNA 靶标 位点 翻译 检测 分析 发现 | ||
1.一种MiR-4660抑制AGXT基因表达引起草酸性结石的分子机制及早期预警方法,其特征在于,所述MiR-4660抑制AGXT基因表达引起草酸性结石的分子机制及早期预警方法包括:
第一步,生物信息学预测:利用DIANA-mT、miRanda、miRDB、miRWalk、RNAhybrid、PICRAR4、PICTAR5、PITA、RNA22、TargetScan的miRNAs与靶标基因结合位点预测软件对AGXT-3’UTR的miRNAs靶标序列进行预测,并通过IBIVU server、UCSC检测结合位点保守性,分析miR-4660和miR-6797的结合AGXT 3-’UTR特性;
第二步,分析miR-4660/miR-697对基因AGXT 3’UTR的影响,确定靶标位点:将AGXT-3’UTR亚克隆至pMIR-Report荧光素酶报告基因下游,表达融合AGXT-3’UTR的重组荧光素酶;将报告载体分别与hsa-miR-4660/hsa-miR-6797 mimics以及随机miRNA序列共同转染Hela细胞,培养后,分析融合重组荧光素酶报告载体荧光值变化;
第三步,利用细胞学水平分析miR-4660对基因AGXT的表达:进行RT-PCR分析、Westernblot分析;
第四步,miRNAs及基因表达水平的检测:进行免疫组化检测、RT-PCR实验检测。
2.如权利要求1所述的MiR-4660抑制AGXT基因表达引起草酸性结石的分子机制及早期预警方法,其特征在于,第二步中,培养48小时后,分析融合重组荧光素酶报告载体荧光值是否有变化;通过连续位点点突变的方法,获取miR-4660/miR-6797具体结合的靶标序列SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6。
3.如权利要求1所述的MiR-4660抑制AGXT基因表达引起草酸性结石的分子机制及早期预警方法,其特征在于,RT-PCR分析的方法包括:
分别将hsa-miR-4660mimics或hsa-miR-4660沉默子antagomir以及随机miRNA序列载体分别转染至L02细胞,转染48小时后,提取细胞总RNA,逆转录成cDNA后,利用设计的AGXT定量引物对cDNA中AGXT的表达水平进行定量测定,检测miRNAs过表达或者干扰miRNAs表达后,AGXT的mRNA水平是否有变化,获得hsa-miR-4660对基因转录水平影响信息;
AGXT定量引物包括SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3。
4.如权利要求1所述的MiR-4660抑制AGXT基因表达引起草酸性结石的分子机制及早期预警方法,其特征在于,Western blot分析方法包括:
分别将hsa-miR-4660mimics或hsa-miR-4660沉默子antagomir以及随机miRNA序列载体分别转染至L02细胞,转染48小时后,提取细胞总蛋白,检测miRNAs过表达或者干扰miRNAs表达后,AGXT蛋白水平差异,获得hsa-miR-4660对基因翻译水平影响信息。
5.如权利要求1所述的MiR-4660抑制AGXT基因表达引起草酸性结石的分子机制及早期预警方法,其特征在于,免疫组化分析方法包括:
对需要进行肝脏穿刺活检的肝脏组织,定制AGXT及hsa-miR-4660特异性探针,石蜡包埋组织后切片染色,分析AGXT及hsa-miR-4660表达水平的差异。
6.如权利要求1所述的MiR-4660抑制AGXT基因表达引起草酸性结石的分子机制及早期预警方法,其特征在于,RT-PCR实验方法包括:
提取草酸结石组和正常对照组外周血标本总RNA,利用miR-4660特异性逆转录引物逆转录并检测miR-4660的表达,分析草酸结石组与正常对照组外周血中AGXT及hsa-miR-4660表达水平的差异。
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