[发明专利]一种自动解析稳定同位素标记糖链定量质谱数据的方法有效

专利信息
申请号: 201811650390.1 申请日: 2018-12-31
公开(公告)号: CN109738532B 公开(公告)日: 2022-07-22
发明(设计)人: 黄江铭;蒋碧云;曹纬倩;杨芃原 申请(专利权)人: 复旦大学
主分类号: G01N30/02 分类号: G01N30/02;G01N30/06;G01N33/68
代理公司: 上海正旦专利代理有限公司 31200 代理人: 陆飞;陆尤
地址: 200433 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明属蛋白质分析技术领域,具体为一种自动解析稳定同位素标记糖链定量质谱数据的方法。本发明利用工具gQuant对MALDI‑MS产出的同位素标记的糖链质量校正从而进行准确相对定量;该工具充分考虑了同位素标记相对定量数据的特点,对同位素交叠进行了准确的校正,并且特别地利用糖链的理论同位素分布模式和质谱碎裂特性设了基于最高理论同位素强度峰定量的算法,对高分子量和低丰度的糖链组分具有更高的定量准确性和鲁棒性。
搜索关键词: 一种 自动 解析 稳定 同位素标记 定量 数据 方法
【主权项】:
1.一种自动解析稳定同位素标记糖链定量质谱数据的方法,其特征在于,基于糖链的理论同位素分布模式和质谱碎裂特性,通过最高理论同位素强度峰定量,对同位素交叠进行准确的校正,具体步骤如下:(1)对公开数据库中的糖链信息,计算出对应的每种糖型对应的元素组成,计算出不同元素天然同位素的二项分布,并进行线性加和,生成理论同位素峰分布;(2)根据步骤(1)的结果,挑选用于定量的同位素峰;(3)对于标记质量差较小的同位素标记定量时,对同位素峰进行准确的校正和交叠部分扣除;(4)通过校正以后的峰强度的比,输出定量结果。
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