[发明专利]癌-睾丸抗原CDCA5作为食管鳞癌预后标志物及治疗靶点在审

专利信息
申请号: 201811625231.6 申请日: 2018-12-28
公开(公告)号: CN109355394A 公开(公告)日: 2019-02-19
发明(设计)人: 许晶;吴卫兵;于跃;李志华;陈亮 申请(专利权)人: 江苏省人民医院(南京医科大学第一附属医院)
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6837;C12N15/11
代理公司: 常州市夏成专利事务所(普通合伙) 32233 代理人: 沈毅
地址: 210000 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种癌‑睾丸抗原CDCA5作为食管鳞癌预后标志物及其治疗靶点,基于GEO、HBM及GTEx等数据库,系统筛选出21个食管鳞癌相关癌睾丸基因,其中,CDCA5表达与食管鳞癌预后显著相关;进一步通过组织生物学和细胞功能学对CDCA5基因的作用机制进行验证分析。本发明首次发现CDCA5为食管鳞癌相关的癌‑睾丸基因,其在食管鳞癌患者癌组织中呈高表达,并与较差的食管鳞癌预后相关,可以作为预测食管鳞癌患者预后的生物标志物;利用shRNA敲降CDCA5基因的表达可以显著抑制食管鳞癌在体内及体外的进展水平,提示CDCA5抗原可以作为食管鳞癌治疗的靶点。
搜索关键词: 食管鳞癌 预后 预后标志物 治疗靶点 睾丸抗原 睾丸 生物标志物 系统筛选 细胞功能 作用机制 基因 癌组织 高表达 抗原 靶点 体外 生物学 数据库 提示 体内 验证 预测 治疗 分析 发现
【主权项】:
1.一种癌‑睾丸抗原CDCA5作为食管鳞癌预后标志物,其特征在于:包括筛选过程,所述筛选利用GEO,HBM以及GTEx数据库筛选出一个与食管癌预后显著相关的癌睾丸基因,即为CDCA5,具体筛选过程如下:(1)利用GEO,HBM以及GTEx数据库,对119对食管鳞癌‑癌旁组织表达芯片数据进行质控,保留25890个高质量探针;(2)进一步筛选出其中的编码蛋白基因以及在睾丸组织呈优势表达的基因,保留764个探针,对应690个基因;(3)基于上述表达芯片数据,进行差异表达分析,筛选出21个食管鳞癌相关癌睾丸基因;(4)对21个食管鳞癌相关癌睾丸基因进行预后关联分析,筛选出一个癌睾丸基因与食管癌预后显著相关,即为CDCA5。
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