[发明专利]癌-睾丸抗原CDCA5作为食管鳞癌预后标志物及治疗靶点在审

专利信息
申请号: 201811625231.6 申请日: 2018-12-28
公开(公告)号: CN109355394A 公开(公告)日: 2019-02-19
发明(设计)人: 许晶;吴卫兵;于跃;李志华;陈亮 申请(专利权)人: 江苏省人民医院(南京医科大学第一附属医院)
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6837;C12N15/11
代理公司: 常州市夏成专利事务所(普通合伙) 32233 代理人: 沈毅
地址: 210000 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 食管鳞癌 预后 预后标志物 治疗靶点 睾丸抗原 睾丸 生物标志物 系统筛选 细胞功能 作用机制 基因 癌组织 高表达 抗原 靶点 体外 生物学 数据库 提示 体内 验证 预测 治疗 分析 发现
【说明书】:

发明公开了一种癌‑睾丸抗原CDCA5作为食管鳞癌预后标志物及其治疗靶点,基于GEO、HBM及GTEx等数据库,系统筛选出21个食管鳞癌相关癌睾丸基因,其中,CDCA5表达与食管鳞癌预后显著相关;进一步通过组织生物学和细胞功能学对CDCA5基因的作用机制进行验证分析。本发明首次发现CDCA5为食管鳞癌相关的癌‑睾丸基因,其在食管鳞癌患者癌组织中呈高表达,并与较差的食管鳞癌预后相关,可以作为预测食管鳞癌患者预后的生物标志物;利用shRNA敲降CDCA5基因的表达可以显著抑制食管鳞癌在体内及体外的进展水平,提示CDCA5抗原可以作为食管鳞癌治疗的靶点。

技术领域

本发明涉及一种癌-睾丸抗原CDCA5,具体为癌-睾丸抗原CDCA5可作为食管鳞癌预后标志物及其治疗靶点,属于癌-睾丸抗原CDCA5应用领域。

背景技术

食管癌是最常见的恶性肿瘤之一,全球范围内,食管癌发病率在所有恶性肿瘤中位居第八位,死亡率位居第六位,每年约有450000人罹患该病。与西方国家不同的是,食管鳞状细胞癌(食管鳞癌)在我国占所有食管癌病例的95%以上。近十余年来,食管鳞癌的综合治疗手段不断进步,但其预后仍不甚理想,其五年总体生存率仅为15%-25%。因此,探索食管鳞癌预后的影响因素,建立相对准确的预后预测模型,以期指导食管癌临床治疗,进而提高患者的治愈率,延长患者生存时间,在我国有着极为重大的临床意义。

目前,临床上常采用第八版TNM分期评估食管鳞癌预后,主要依据食管鳞癌原发灶浸润深度、分化程度、肿瘤部位、有无淋巴结及远处转移等临床因素来预测食管鳞癌患者的远期生存情况。然而,大量研究证实,肿瘤的预后不仅与TNM分期有关,而且受到遗传因素的影响。传统的TNM分期仅考虑临床病理因素,因而无法较为精确地预测食管鳞癌患者的预后。因此,探寻食管鳞癌发生发展过程中的关键预后分子,筛选与食管鳞癌预后有关的分子标志物并作为治疗靶点,继而进行个体化治疗是当今肿瘤研究的热点,也是改善肿瘤患者生存及预后的必经之路。

癌-睾丸基因(Cancer/testis genes,CT基因)是指一类仅在睾丸组织及恶性肿瘤组织中高表达,其它正常组织不表达或低表达的基因。与正常组织不同的是,肿瘤组织中表达的癌-睾丸抗原 (Cancer/testis antigens)具有免疫原性,能够诱导免疫反应,因而可作为恶性肿瘤免疫治疗的靶点。目前,已经有多种以癌-睾丸抗原为靶点的药物正在临床试验阶段,包括以MAGE-A3,PASD1以及MAGE-A1等抗原为免疫治疗靶点的药物。

既往研究已经发现了多个与食管鳞癌发生进展有关的癌-睾丸基因,如MAGE-A4,LAGE1,CT45等。然而,目前尚无研究系统地筛选食管鳞癌相关的癌-睾丸抗原并探索其与食管鳞癌预后的关联。因此,系统筛选食管鳞癌相关癌-睾丸抗原,解析其潜在的生物学机制,并作为预测食管鳞癌预后标志物,指导食管鳞癌患者的个体化治疗,对我国食管鳞癌的临床诊疗具有重大的创新性意义。

发明内容

本发明的目的就在于为了解决上述问题而提供一种癌-睾丸抗原CDCA5作为食管鳞癌预后标志物及治疗靶点。

本发明通过以下技术方案来实现上述目的,一种癌-睾丸抗原CDCA5作为食管鳞癌预后标志物,包括筛选过程,所述筛选利用GEO,HBM以及GTEx数据库筛选出一个与食管癌预后显著相关的癌睾丸基因,即为CDCA5,具体筛选过程如下:

(1)利用GEO,HBM以及GTEx数据库,对119对食管鳞癌-癌旁组织表达芯片数据进行质控,保留25890个高质量探针;

(2)进一步筛选出其中的编码蛋白基因以及在睾丸组织呈优势表达的基因,保留764个探针,对应690个基因;

(3)基于上述表达芯片数据,进行差异表达分析,筛选出21个食管鳞癌相关癌睾丸基因;

(4)对21个食管鳞癌相关癌睾丸基因进行预后关联分析,筛选出一个癌睾丸基因与食管癌预后显著相关,即为CDCA5。

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